135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0396 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  91 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  91 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  91 
 
 
212 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  89.52 
 
 
212 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  89.05 
 
 
212 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  87.68 
 
 
212 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  75.24 
 
 
212 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  75.71 
 
 
253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  75.71 
 
 
212 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  72.86 
 
 
216 aa  324  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  75.71 
 
 
212 aa  324  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  75.71 
 
 
212 aa  324  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  75.71 
 
 
212 aa  324  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  75.71 
 
 
212 aa  324  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  75.71 
 
 
212 aa  324  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  73.17 
 
 
212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  72.86 
 
 
212 aa  317  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  72.86 
 
 
212 aa  317  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  69.67 
 
 
212 aa  307  8e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  64.15 
 
 
212 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  64.15 
 
 
212 aa  290  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  65.53 
 
 
210 aa  285  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  65.24 
 
 
212 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  62.79 
 
 
216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  57.35 
 
 
216 aa  262  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  60.36 
 
 
223 aa  261  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  60.39 
 
 
213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  57.77 
 
 
227 aa  247  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  54.59 
 
 
206 aa  224  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  53.55 
 
 
232 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  46.67 
 
 
212 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  46.43 
 
 
214 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  46.8 
 
 
219 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  46.8 
 
 
219 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.92 
 
 
214 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  45.88 
 
 
212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.81 
 
 
218 aa  179  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  45.81 
 
 
218 aa  179  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  47.31 
 
 
209 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  45.81 
 
 
218 aa  179  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  45.18 
 
 
213 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  45.18 
 
 
217 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  46.37 
 
 
205 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  44.62 
 
 
216 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  41.84 
 
 
202 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.31 
 
 
207 aa  164  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  42.27 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.84 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.33 
 
 
210 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.1 
 
 
208 aa  161  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.27 
 
 
209 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  41.33 
 
 
214 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  42.45 
 
 
212 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.72 
 
 
209 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.72 
 
 
209 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.47 
 
 
211 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.13 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50195  predicted protein  36.49 
 
 
221 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273335  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  42.35 
 
 
207 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.9 
 
 
210 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.87 
 
 
212 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.76 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.35 
 
 
211 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  41.67 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.67 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  37.02 
 
 
251 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.27 
 
 
223 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  40.1 
 
 
218 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.66 
 
 
207 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.86 
 
 
202 aa  141  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.71 
 
 
207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.24 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.82 
 
 
224 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0083  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.22 
 
 
200 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.84 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.56 
 
 
205 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.56 
 
 
205 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.92 
 
 
209 aa  121  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.06 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  33.5 
 
 
199 aa  118  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  33.16 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.18 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  33.5 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  33.5 
 
 
199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.04 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.16 
 
 
199 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  35.6 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  33.81 
 
 
227 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  33.81 
 
 
227 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.95 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.89 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  33.7 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.15 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  33.15 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.95 
 
 
207 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  33.33 
 
 
227 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.44 
 
 
207 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3641  negative transcriptional regulator  29.56 
 
 
210 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.691719  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  30.3 
 
 
207 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>