136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5889 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  430  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.48 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.92 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.71 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.71 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.71 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.71 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  40.19 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.23 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  39.23 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.96 
 
 		 199 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  37.44 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  37.44 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  37.13 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  36.82 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.63 
 
 		 201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.47 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  35.47 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  33.99 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  34.98 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  34.98 
 
 		 199 aa  130  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.23 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.84 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  36.73 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  35.75 
 
 		 212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  36 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  35.75 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  36.56 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2362  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.1 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.14 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.22 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.77 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  31.13 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  31.58 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  34.54 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 208 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  31.66 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  31.88 
 
 		 218 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 251 aa  92.8  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.5 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  32.31 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.52 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4489  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 218 aa  91.3  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2838  negative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0668939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  89  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50195  predicted protein  27.55 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>