135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2838 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2838  negative transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0668939  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3679  FMN-binding negative transcriptional regulator  43.78 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0320  negative transcriptional regulator  42.2 
 
 		 217 aa  137  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  34.17 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.91 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3982  negative transcriptional regulator  37.02 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.69 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.02 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2973  negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  35.18 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0083  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.3 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  35.18 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2769  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.72 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  37.07 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  33.5 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 218 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  34.16 
 
 		 212 aa  98.2  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.37 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 251 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  32.29 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  32.45 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.8 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2487  negative transcriptional regulator  34.57 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.234096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  29.23 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.86 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  33.65 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.86 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  28.87 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  31.77 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  32.46 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.36 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.96 
 
 		 212 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_003296  RS01760  hypothetical protein  32.29 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.233372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  32.67 
 
 		 253 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  32.67 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  30.1 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2824  negative transcriptional regulator  33.65 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.72 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.73 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  31.73 
 
 		 219 aa  89  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.49 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.87 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.57 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.95 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.57 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  30.35 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.57 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 218 aa  85.5  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  29.56 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  30.48 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 207 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 227 aa  84.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.03 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.03 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4832  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.54 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.43 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  33.99 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>