132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3679 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3679  FMN-binding negative transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.434689  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2838  negative transcriptional regulator  43.78 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0668939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3982  negative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0320  negative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2973  negative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2824  negative transcriptional regulator  42.39 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2487  negative transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.234096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2769  FMN-binding negative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3668  negative transcriptional regulator  32.62 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  37.42 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 217 aa  95.9  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.78 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.78 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.29 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  27.45 
 
 		 219 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 227 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 207 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  28.64 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.04 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  30.21 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  27.23 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  27.23 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.17 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2039  hypothetical protein  35.76 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.53 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  27.13 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.83 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.43 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.17 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  31.28 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  29.17 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  28.65 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 216 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  31.49 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1141  FMN-binding negative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4524  negative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00396175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3110  negative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5257  negative transcriptional regulator  30.39 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4787  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.83 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  35.5 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  30.65 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  30.72 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  33.93 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.52 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.18 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  32.18 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  32.18 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  32.85 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  35.6 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  33.68 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3155  transcriptional regulator-like  32.73 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.221004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2455  negative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.361522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  32 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  36.88 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.23 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3490  Negative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>