131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4489 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4489  FMN-binding negative transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  32.69 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0131  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.19 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  28.5 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1661  negative transcriptional regulator  29.22 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  27.54 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  27.05 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  27.54 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  27.54 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5118  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000184887  normal  0.127923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 236 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0823  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00293061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  26.29 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5889  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05600  Negative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.592075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  31.96 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3371  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.721094  normal  0.299438 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2362  FMN-binding negative transcriptional regulator  34.71 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.73 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  29.19 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8096  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3744  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0275  negative transcriptional regulator  26.77 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.594714  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.25 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.24 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2719  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.66 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.73362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.37 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.96 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2807  transcriptional regulator, putative  28.44 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.233937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2433  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00303402  hitchhiker  0.0000000627876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2763  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  26.63 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  28.73 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1155  negative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  24.23 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4337  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0091  negative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  24.76 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  24.76 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  24.76 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  24.76 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5634  negative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166021  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  28.79 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2006  transcriptional regulator, putative  27.67 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1673  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  24.27 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.47 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5343  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  unclonable  0.000000472337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  29.27 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5252  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.593041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4597  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  28.42 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1332  FMN-binding negative transcriptional regulator  24 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0027  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.32 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.467521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0320  negative transcriptional regulator  29.67 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5016  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.213786  normal  0.76718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0396  negative transcriptional regulator  27.89 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  28.42 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1557  transcriptional regulator PaiB-like protein  28.42 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0910  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.46 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3641  negative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.691719  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5850  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3457  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>