169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4862 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  100 
 
 
333 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  100 
 
 
333 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  93.35 
 
 
333 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  69.3 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  64.67 
 
 
332 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  64.37 
 
 
335 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  43.08 
 
 
346 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  42.77 
 
 
343 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  42.15 
 
 
343 aa  235  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  40.68 
 
 
342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  40.91 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  39.63 
 
 
340 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  40.44 
 
 
341 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  40.44 
 
 
341 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  37.54 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  39.58 
 
 
343 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  38.51 
 
 
329 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  40.63 
 
 
325 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  34.07 
 
 
321 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  40.07 
 
 
326 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  39.49 
 
 
326 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  36.91 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  34.94 
 
 
332 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  36.51 
 
 
330 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  37.79 
 
 
319 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  31.55 
 
 
330 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  36.71 
 
 
343 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  37.26 
 
 
339 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  33.65 
 
 
322 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  33.02 
 
 
322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  33.75 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  37.98 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  33.02 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  32.91 
 
 
321 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
616 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  36.74 
 
 
319 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  33.11 
 
 
335 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  34.98 
 
 
336 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  32.79 
 
 
335 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  31.89 
 
 
318 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  36.54 
 
 
339 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  36.16 
 
 
313 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  35.1 
 
 
313 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  35.65 
 
 
331 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  36.22 
 
 
319 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  35.22 
 
 
332 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  35.53 
 
 
324 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  32.06 
 
 
323 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  35.58 
 
 
319 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  32.06 
 
 
323 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  32.06 
 
 
323 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  36.01 
 
 
318 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  32.09 
 
 
367 aa  149  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  35.9 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  31.82 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  32.33 
 
 
334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  32.48 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  32.36 
 
 
321 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  31.19 
 
 
321 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  31.19 
 
 
321 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  31.19 
 
 
321 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  35.31 
 
 
324 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  31.19 
 
 
321 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  28.85 
 
 
320 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  31.51 
 
 
321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  30.87 
 
 
321 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  31.69 
 
 
321 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  34.3 
 
 
322 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  29.88 
 
 
351 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  32.89 
 
 
326 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  35.39 
 
 
322 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  29.88 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  31.12 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
639 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  28.79 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  33.01 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  28.79 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  30.03 
 
 
341 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  35.02 
 
 
320 aa  139  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  32.8 
 
 
337 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  33.64 
 
 
327 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  30 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  34.98 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  33.94 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  33.33 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  34.76 
 
 
351 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
638 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  32.11 
 
 
337 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
638 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
642 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
642 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
642 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>