169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3594 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  100 
 
 
342 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  68.79 
 
 
346 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  65.5 
 
 
343 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  64.91 
 
 
343 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  66.16 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  66.36 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  62.16 
 
 
339 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  60.36 
 
 
340 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  45.24 
 
 
335 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  42.26 
 
 
332 aa  229  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  41.61 
 
 
333 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  39.87 
 
 
319 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  40.68 
 
 
333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  40.68 
 
 
333 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  40.96 
 
 
333 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  40.06 
 
 
321 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  40.06 
 
 
321 aa  215  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  40.06 
 
 
321 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  40.06 
 
 
321 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  40.06 
 
 
321 aa  215  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  40.06 
 
 
321 aa  215  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  40.06 
 
 
321 aa  215  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  40.06 
 
 
321 aa  215  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  40.06 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  38.91 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  39.35 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  38.06 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  38.06 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  38.06 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  38.71 
 
 
321 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  38.71 
 
 
321 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  38.71 
 
 
321 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  38.71 
 
 
321 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  38.71 
 
 
321 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  35.03 
 
 
321 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  36.77 
 
 
322 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  36.45 
 
 
322 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  35.16 
 
 
321 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  38.89 
 
 
321 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  38.14 
 
 
321 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  38.16 
 
 
330 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  39.81 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  34.89 
 
 
320 aa  196  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  36.47 
 
 
343 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  36.47 
 
 
330 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  37.22 
 
 
317 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  38.96 
 
 
318 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  34.41 
 
 
332 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  39.74 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  37.74 
 
 
319 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  35.35 
 
 
334 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  38.31 
 
 
322 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  37.22 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  37.42 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  35.71 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  37.1 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  35.59 
 
 
335 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  37.1 
 
 
319 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  37.75 
 
 
326 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  35.59 
 
 
335 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  37.26 
 
 
329 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  35.87 
 
 
335 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  35.74 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  35.13 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  35.22 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  35.29 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  36.94 
 
 
324 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  33.74 
 
 
339 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  36.28 
 
 
343 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  33.85 
 
 
341 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  35.49 
 
 
337 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  37.37 
 
 
322 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  34.05 
 
 
337 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
641 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  38.39 
 
 
321 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
641 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  37.66 
 
 
324 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  33.74 
 
 
337 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
641 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
641 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  38.06 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  34.8 
 
 
335 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  34.41 
 
 
326 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  38.91 
 
 
319 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
616 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
641 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
642 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
639 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  34.41 
 
 
328 aa  159  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
620 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
620 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
620 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  37.01 
 
 
322 aa  159  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  36.17 
 
 
351 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
642 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
642 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
642 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
642 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3540  glucokinase  36.93 
 
 
322 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0363  glucokinase  35.53 
 
 
320 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>