172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0363 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0363  glucokinase  100 
 
 		 320 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  36.79 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  33.75 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  35.53 
 
 		 342 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  33.12 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  33.54 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  33.54 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  33.54 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  30.06 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  34.82 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  32.92 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  33.75 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  31.55 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  33.66 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  31.66 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  30.41 
 
 		 321 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  31.35 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  31.35 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  29.38 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  31.45 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  31.35 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  32.35 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  31.35 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  31.35 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  35.6 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  33.01 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  36.2 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  28.96 
 
 		 330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  30.94 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  31.03 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  32.08 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3425  glucokinase  30.53 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0648425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  31.03 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  31.66 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  35.44 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  29.25 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  29.78 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  31.96 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  31.63 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  29.43 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  30.7 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  31.94 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  34.63 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  32.4 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  32.69 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  31.46 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  29.25 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  33.44 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  28.83 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  30.79 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  32.28 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 616 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  30.7 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  33.33 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  27.91 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  28.78 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  33.99 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  28.1 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  33.99 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  29.34 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  28.28 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  28.48 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  31.33 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  29.17 
 
 		 341 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  28.09 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  32.18 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  29.26 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  32.6 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  31.86 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0832  glucokinase  32.81 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889117  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  31.51 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  29.48 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  32.6 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  30.59 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  31.42 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  31.42 
 
 		 351 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  28.31 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  27.63 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  30.5 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  28.12 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  29.76 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  31.11 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 641 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  27.16 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1119  glucokinase  30.72 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 642 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 642 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 642 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  28.27 
 
 		 327 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 641 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 641 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 642 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>