170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0507 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  100 
 
 		 320 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  43.24 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  40.37 
 
 		 334 aa  228  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  40.74 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  40.12 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  38.19 
 
 		 341 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  37.13 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  35.94 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  35.94 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  36.96 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  38.26 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  34.09 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  35.49 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  35.03 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  33.66 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  35.26 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  37.62 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  34.65 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  34.65 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  34.38 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  32.8 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  31.44 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  31.6 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0561  glucokinase  37.99 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  33.01 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  33.98 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  33.01 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  33.01 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  33.01 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  32.79 
 
 		 321 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  30.23 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3171  glucokinase  35.34 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  32.79 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  32.79 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  32.79 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  32.79 
 
 		 321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  31.61 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  32.79 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  31.07 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  31.43 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  33.73 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  31.94 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  33.64 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  32.14 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  32.14 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  32.14 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  32.14 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  32.14 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  32.14 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  32.14 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  32.57 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  31.49 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  32.14 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  34.17 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  34.17 
 
 		 335 aa  148  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  31.02 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  31.1 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  31.72 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  32.14 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  30.77 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  28.99 
 
 		 341 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  30.74 
 
 		 342 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  32.18 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  30.77 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  34.11 
 
 		 339 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 616 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  30.32 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  31.41 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  30.45 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  27.99 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  32.37 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  27.99 
 
 		 347 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  32.91 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  31.41 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 641 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  30.77 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 641 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 641 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  32.48 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 641 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 641 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  29.97 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  30.97 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 620 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  28.95 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 620 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 620 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 642 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 642 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 642 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 642 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 639 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 642 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  33.46 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  31.97 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  27.49 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 642 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 642 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 638 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 638 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>