169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2002 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  100 
 
 		 327 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  96.33 
 
 		 327 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  44.38 
 
 		 341 aa  259  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  43.22 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  41.79 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  42.81 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  42.9 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  42.46 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0561  glucokinase  46.79 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  42.2 
 
 		 349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  42.2 
 
 		 349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  43.61 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  41.52 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  39.2 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  40.12 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  40.12 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3171  glucokinase  39.94 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  37.22 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  37.61 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  36.28 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  36.31 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  34.57 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  37.38 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  37.38 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  37.38 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  37.03 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  36.68 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  36.45 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  36.79 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  35.17 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  36.14 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  36.79 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  37.22 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  35.44 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  36.59 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  35.44 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  35.44 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  36.05 
 
 		 319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  35.44 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  35.13 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  31.86 
 
 		 321 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  33.64 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  36.16 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  33.12 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  35.2 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  32.71 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  34.33 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  33.33 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  33.73 
 
 		 357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  32.54 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  36.25 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  32.44 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  31.09 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3425  glucokinase  33.96 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0648425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  34.07 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  34.37 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  34.06 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  31.21 
 
 		 347 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  33.84 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  32.6 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  32.6 
 
 		 335 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48774  glucokinase  31.27 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.985035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  33.02 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  31.56 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  35.62 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  30.21 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  30.5 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  31.87 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  33.13 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  29.74 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  31.76 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  30.84 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  33.02 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  31.17 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  33.33 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  33.64 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  33.64 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  33.13 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  30.84 
 
 		 346 aa  135  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  32.09 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  30.22 
 
 		 343 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  32.38 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  31.58 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  33.64 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 616 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  29 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  32.06 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  33.13 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2672  glucokinase  31.94 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  32.42 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0803  glucokinase  32.2 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1766  glucokinase  36.2 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  32.61 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.373771 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>