170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2721 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  100 
 
 
338 aa  671    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  43.67 
 
 
335 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  41.1 
 
 
334 aa  222  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  38.71 
 
 
342 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  39.56 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  37.57 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1981  Glucokinase  47.04 
 
 
328 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  36.49 
 
 
349 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  36.49 
 
 
349 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  42.01 
 
 
345 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  39.59 
 
 
341 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  38.1 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  37.61 
 
 
327 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  37.61 
 
 
327 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  34.2 
 
 
353 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  35.49 
 
 
320 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  35.26 
 
 
367 aa  179  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  32.72 
 
 
330 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  33.44 
 
 
321 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  38.21 
 
 
326 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  39.26 
 
 
326 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  36.25 
 
 
344 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  37.98 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  38.28 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  34.94 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  39.27 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  32.11 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  40.54 
 
 
332 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  34.74 
 
 
357 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  34.67 
 
 
322 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  32.51 
 
 
318 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  35.74 
 
 
342 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  34.66 
 
 
321 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  35.17 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  35.84 
 
 
339 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  29.15 
 
 
345 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  35.93 
 
 
333 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  35.54 
 
 
319 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3171  glucokinase  34.68 
 
 
361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  32.31 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  33.63 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  28.57 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  32.42 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  31.4 
 
 
339 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  32.51 
 
 
319 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  34.22 
 
 
353 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  32 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  32.72 
 
 
321 aa  146  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0561  glucokinase  38.79 
 
 
330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  33.02 
 
 
315 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  32.54 
 
 
343 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  35.42 
 
 
333 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  32.62 
 
 
321 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1521  glucokinase  37.69 
 
 
317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540329  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  31.36 
 
 
341 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  27.94 
 
 
344 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  32.1 
 
 
320 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  30.89 
 
 
323 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  30.89 
 
 
323 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  30.89 
 
 
323 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  34.12 
 
 
317 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  32.35 
 
 
346 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  37.39 
 
 
317 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  32.44 
 
 
322 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  34.91 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  35.93 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  32.74 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  32.92 
 
 
321 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  30.56 
 
 
321 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  27.35 
 
 
344 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  30.56 
 
 
321 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  34.23 
 
 
313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  30.56 
 
 
321 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  30.56 
 
 
321 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  30.56 
 
 
321 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  30.25 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  31.23 
 
 
324 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  33.64 
 
 
343 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  33.75 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  30.63 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  33.13 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  30.25 
 
 
321 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  33.24 
 
 
340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  28.86 
 
 
341 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  32.92 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  31.86 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  29.02 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  31.27 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  29.94 
 
 
335 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  27.52 
 
 
320 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3425  glucokinase  32.12 
 
 
339 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0648425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  32.72 
 
 
339 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>