169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0373 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  99.11 
 
 
337 aa  679    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  100 
 
 
337 aa  683    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  76.31 
 
 
328 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  73.1 
 
 
335 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  42.81 
 
 
322 aa  235  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  41.43 
 
 
321 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  41.43 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  41.43 
 
 
321 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  41.43 
 
 
321 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  41.43 
 
 
321 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  41.8 
 
 
322 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  41.12 
 
 
321 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  41.12 
 
 
321 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  41.12 
 
 
321 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  41.12 
 
 
321 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  41.12 
 
 
321 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  41.12 
 
 
321 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  41.12 
 
 
321 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  41.12 
 
 
321 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  41.12 
 
 
321 aa  229  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  41.07 
 
 
323 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  41.07 
 
 
323 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  41.12 
 
 
320 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  41.07 
 
 
323 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  41.32 
 
 
329 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  40.62 
 
 
332 aa  222  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  40 
 
 
321 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  39.88 
 
 
321 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  39.12 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  38.34 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  38.32 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  36.68 
 
 
320 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  37.85 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  34.15 
 
 
318 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  34.88 
 
 
330 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
641 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
641 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
641 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
641 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
641 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
639 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  39.26 
 
 
339 aa  192  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  36.12 
 
 
339 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  36.92 
 
 
346 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  36.34 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
620 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
616 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  37.1 
 
 
330 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
620 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
620 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  37.5 
 
 
324 aa  189  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  37.27 
 
 
343 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  36.92 
 
 
342 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  38.49 
 
 
322 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  34.47 
 
 
325 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
638 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
638 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  36.92 
 
 
343 aa  185  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  36.62 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  35.11 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  38.2 
 
 
339 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
642 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
642 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
642 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  35.71 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
642 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.03 
 
 
642 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  34.57 
 
 
321 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  34.88 
 
 
321 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  37.38 
 
 
319 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  37.22 
 
 
320 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
642 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
642 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  36.65 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  35.28 
 
 
318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3540  glucokinase  37.38 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  37.07 
 
 
320 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  36.81 
 
 
332 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  36.02 
 
 
324 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  35.31 
 
 
335 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  38.48 
 
 
351 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  35.58 
 
 
340 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  36.05 
 
 
322 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  38.48 
 
 
351 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  35 
 
 
335 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  33.23 
 
 
326 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  37.58 
 
 
351 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  33.85 
 
 
326 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  35.89 
 
 
319 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  35.4 
 
 
339 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  34.98 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  34.69 
 
 
326 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  34.28 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  31.33 
 
 
334 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  35.4 
 
 
335 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1766  glucokinase  35 
 
 
340 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  32.2 
 
 
341 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  36.71 
 
 
322 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  35.63 
 
 
337 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  37.34 
 
 
323 aa  159  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>