170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5260 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  100 
 
 
335 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  82.73 
 
 
332 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  64.37 
 
 
333 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  64.07 
 
 
333 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  63.91 
 
 
333 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  62.13 
 
 
333 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  45.24 
 
 
342 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  43.88 
 
 
343 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  43.28 
 
 
343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  44.18 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  41.79 
 
 
339 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  41.44 
 
 
341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  40.54 
 
 
340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  41.14 
 
 
341 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  40.18 
 
 
334 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  40.48 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  40.99 
 
 
325 aa  189  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  34.58 
 
 
321 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  38.75 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  39.13 
 
 
316 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  33.85 
 
 
330 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  40.82 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  38.73 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  32.51 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  39.27 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  36.04 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  38.61 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  36.77 
 
 
321 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  35.26 
 
 
323 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  34.48 
 
 
322 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  35.26 
 
 
323 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  35.26 
 
 
323 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  36 
 
 
313 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  33.97 
 
 
321 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  34.18 
 
 
309 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  38.7 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  35.96 
 
 
321 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
616 aa  156  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  32.39 
 
 
332 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  35.74 
 
 
343 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  34.49 
 
 
321 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  153  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  33.87 
 
 
321 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  34.3 
 
 
322 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  34.29 
 
 
320 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  33.96 
 
 
317 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  33.01 
 
 
335 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  30.72 
 
 
320 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  30.58 
 
 
367 aa  149  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  36.86 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  32.36 
 
 
335 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  32.63 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  32.73 
 
 
341 aa  146  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  32.72 
 
 
334 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
639 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  33.43 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
638 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  35.99 
 
 
319 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  37.06 
 
 
339 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  30.46 
 
 
345 aa  143  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  35.53 
 
 
318 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  30.77 
 
 
341 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  34.38 
 
 
324 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  37.22 
 
 
326 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  36.62 
 
 
320 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
638 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  37.06 
 
 
331 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  33.12 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  36.54 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  35.19 
 
 
322 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  35.56 
 
 
319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
642 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
642 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  35.53 
 
 
332 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  35.56 
 
 
320 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
642 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
642 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
642 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  33.23 
 
 
335 aa  138  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  35.29 
 
 
319 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  32.62 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
642 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
642 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>