170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0008 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  100 
 
 
313 aa  614  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1119  glucokinase  54.88 
 
 
313 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  41.08 
 
 
316 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  42.27 
 
 
324 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  38.82 
 
 
329 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  41.21 
 
 
325 aa  189  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  40.89 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  39.6 
 
 
321 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  37.11 
 
 
321 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  39.22 
 
 
323 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  39.22 
 
 
323 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  39.22 
 
 
323 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  40.39 
 
 
330 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  42.81 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  37.62 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  37.81 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  34.82 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
639 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
641 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
641 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
641 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
641 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  36.33 
 
 
319 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  36.67 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  43 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  37.1 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
638 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
638 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
641 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  35.25 
 
 
320 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
620 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
620 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
620 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  37.58 
 
 
322 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  38.73 
 
 
326 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
642 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
642 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
642 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  35.93 
 
 
332 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  37.62 
 
 
322 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
642 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  37.21 
 
 
320 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  35.85 
 
 
320 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
642 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  41.06 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
642 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  36.31 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
642 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  36.02 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  37.46 
 
 
321 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  37.33 
 
 
321 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  42.81 
 
 
322 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  35.43 
 
 
321 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  35.43 
 
 
321 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  35.43 
 
 
321 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  35.43 
 
 
321 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  35.43 
 
 
321 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  36.51 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  36.51 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  36.51 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  36.51 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  36.51 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  36.51 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  36.51 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  36.51 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  36.51 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  34.91 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  32.28 
 
 
330 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  35.53 
 
 
333 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  36.6 
 
 
321 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  31.38 
 
 
318 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  36 
 
 
335 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  38.16 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  35.05 
 
 
326 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  35.1 
 
 
333 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  31.55 
 
 
334 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  37.3 
 
 
313 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  35.1 
 
 
333 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
616 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  34.24 
 
 
335 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  35.56 
 
 
333 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2672  glucokinase  37.09 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  35.91 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  37.31 
 
 
351 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  33.9 
 
 
335 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  35.74 
 
 
332 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  40.06 
 
 
337 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  36.7 
 
 
351 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  32.89 
 
 
342 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  36.7 
 
 
351 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  37.66 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  37.46 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0832  glucokinase  35.78 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889117  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  34.55 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3372  Glucokinase  42.77 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  32.08 
 
 
339 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  33.44 
 
 
326 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  32.08 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  33.33 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  35.6 
 
 
332 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>