170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1872 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  100 
 
 
334 aa  685    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  50.75 
 
 
335 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  41.67 
 
 
351 aa  258  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  41.23 
 
 
342 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  42.46 
 
 
327 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  42.15 
 
 
349 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  42.15 
 
 
349 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  42.23 
 
 
341 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  41.85 
 
 
327 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  40.96 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  41.36 
 
 
353 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  40.25 
 
 
309 aa  232  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  40.37 
 
 
320 aa  228  9e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  37.76 
 
 
323 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  37.76 
 
 
323 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  37.76 
 
 
323 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  41.1 
 
 
338 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  37.35 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  37.72 
 
 
322 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  40.73 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  37.13 
 
 
322 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  37.16 
 
 
321 aa  209  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  36.53 
 
 
321 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  202  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  35.33 
 
 
321 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  35.37 
 
 
320 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  35.33 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  38.75 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  36.56 
 
 
321 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  35.76 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0561  glucokinase  40.06 
 
 
330 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  37.57 
 
 
344 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  35.63 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  34.49 
 
 
330 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  36.92 
 
 
319 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  39.22 
 
 
338 aa  186  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  34.57 
 
 
341 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  34.57 
 
 
339 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  33.23 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  35.82 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  36.81 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  33.14 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  33.63 
 
 
346 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  32.4 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  33.23 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  34.14 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  33.23 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  32.84 
 
 
347 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  34.77 
 
 
329 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  32.54 
 
 
341 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  29.57 
 
 
345 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  31.49 
 
 
344 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  33.85 
 
 
316 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  35 
 
 
323 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  34.38 
 
 
321 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3171  glucokinase  34.96 
 
 
361 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  28.88 
 
 
320 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  34.05 
 
 
321 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  36.04 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  30.96 
 
 
317 aa  165  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  30.9 
 
 
344 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  32.92 
 
 
332 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  37.27 
 
 
322 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  32.92 
 
 
326 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  36.5 
 
 
325 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  32.92 
 
 
342 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
616 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  33.54 
 
 
343 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  31.55 
 
 
313 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  38.46 
 
 
322 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  33.53 
 
 
324 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  33.13 
 
 
343 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  32.6 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  32.49 
 
 
346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3540  glucokinase  32.83 
 
 
322 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  31.91 
 
 
332 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  32.31 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  32.33 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  33.47 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  31.06 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  32.33 
 
 
333 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  31.07 
 
 
320 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  30.63 
 
 
319 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  34.67 
 
 
317 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  30.72 
 
 
337 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  31.58 
 
 
335 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  32.48 
 
 
330 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  32.08 
 
 
328 aa  142  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  29.85 
 
 
319 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>