169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4908 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  100 
 
 
333 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  93.35 
 
 
333 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  93.35 
 
 
333 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  68.39 
 
 
333 aa  434  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  64.67 
 
 
332 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  64.07 
 
 
335 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  42.81 
 
 
346 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  42.22 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  41.62 
 
 
343 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  41.61 
 
 
342 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  40.48 
 
 
339 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  39.33 
 
 
340 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  39.63 
 
 
341 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  39.63 
 
 
341 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  39.27 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  37.24 
 
 
334 aa  196  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  34.7 
 
 
321 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  37.85 
 
 
329 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  40.72 
 
 
326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  40.32 
 
 
325 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  37.5 
 
 
330 aa  179  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  39.17 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  31.55 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  34.29 
 
 
332 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  39.67 
 
 
319 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  35.96 
 
 
316 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  33.44 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  37.26 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  33.23 
 
 
322 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  32.6 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
616 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  32.6 
 
 
322 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  35.53 
 
 
313 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  35.44 
 
 
343 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  33.65 
 
 
336 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  32.31 
 
 
318 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  36.22 
 
 
339 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  35.62 
 
 
318 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  35.99 
 
 
331 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  35.78 
 
 
322 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  35.78 
 
 
319 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  35.93 
 
 
338 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  35.88 
 
 
332 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  32.06 
 
 
323 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  32.06 
 
 
323 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  32.06 
 
 
323 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  32.18 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  31.8 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  34.94 
 
 
319 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  31.48 
 
 
335 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  29.18 
 
 
320 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  31.82 
 
 
321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  31.82 
 
 
321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  31.49 
 
 
321 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  34.29 
 
 
319 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  35.18 
 
 
313 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  32.91 
 
 
320 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  34.94 
 
 
320 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  31.51 
 
 
321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  31.83 
 
 
321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  31.51 
 
 
321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  31.51 
 
 
321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  31.51 
 
 
321 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  33.65 
 
 
324 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
639 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  33 
 
 
326 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  31.76 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  36.04 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  32.73 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  29.88 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  34.31 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  31.33 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  30.23 
 
 
321 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  28.48 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  35 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  28.48 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  32.02 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  34.82 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  30.03 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  33.12 
 
 
337 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
638 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
638 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  32.69 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  33.23 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
642 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
641 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
641 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  34.6 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
642 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
641 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
641 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>