170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3369 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  100 
 
 		 339 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  69.23 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  69.82 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  62.16 
 
 		 342 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  65 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  60.96 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  59.88 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  59.28 
 
 		 343 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  44.18 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  42.39 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  42.34 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  40.91 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  40.91 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  40.48 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  35.44 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  38.24 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  37.74 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  38.97 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  36.66 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  37.54 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  37.58 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  36.13 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  36.77 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  36.77 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  36.77 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  36.86 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  36.86 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  36.86 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  36.86 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  39.68 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  36.45 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  36.86 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  36.45 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  37.3 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  35.48 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  34.09 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  36.36 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  34.92 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  35.47 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  36.18 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  37.62 
 
 		 318 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  36.42 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  34.39 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  31.29 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  38.54 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  33.87 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  33.13 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  39.09 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  34.84 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  39.16 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  35.06 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  35.69 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  35.39 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  39.61 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  33.64 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  33.13 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  35.16 
 
 		 326 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  37.18 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  33.02 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  33.12 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  38.2 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  39.41 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  33.12 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  34.98 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 642 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 641 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 642 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 642 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 642 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  34.7 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  35.02 
 
 		 343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 641 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 642 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 641 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 641 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  35.83 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0363  glucokinase  36.79 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  33.97 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  34.08 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  34.69 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 642 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 642 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 620 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 620 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 620 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  35.83 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  37.9 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  33.64 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  31.75 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 641 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 638 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 638 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 639 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>