169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2915 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  100 
 
 
334 aa  676    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  50.75 
 
 
343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  40.18 
 
 
335 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  40.41 
 
 
332 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  37.54 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  36.04 
 
 
343 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  35.42 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  37.54 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  37.54 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  37.24 
 
 
333 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  35.44 
 
 
343 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  35.35 
 
 
342 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  36.94 
 
 
333 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  36.64 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  34.55 
 
 
321 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  35.35 
 
 
341 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  34.94 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  38.61 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  32.63 
 
 
332 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  34.77 
 
 
321 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  34.44 
 
 
321 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  34.77 
 
 
321 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  34.77 
 
 
321 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  34.77 
 
 
321 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  34.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  34.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  34.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  34.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  34.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  34.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  34.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  34.11 
 
 
321 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  33.77 
 
 
321 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  30.67 
 
 
320 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  33.67 
 
 
320 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  33.44 
 
 
321 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  34.78 
 
 
322 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  34.84 
 
 
321 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  33.23 
 
 
326 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  34.33 
 
 
322 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  32.55 
 
 
323 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  32.55 
 
 
323 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  32.55 
 
 
323 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  33.66 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  34.42 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  33.66 
 
 
335 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  35.78 
 
 
313 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  32.1 
 
 
329 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  35.24 
 
 
325 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  30.7 
 
 
318 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  31.56 
 
 
321 aa  142  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
616 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  34.31 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  31.35 
 
 
317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  30.65 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  33.66 
 
 
319 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  31.23 
 
 
316 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  33.64 
 
 
339 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  30.61 
 
 
341 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  33.12 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  30.7 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  33.13 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  32.81 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  33.85 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
638 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  31.56 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  30.89 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  33.12 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  29.87 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  34.65 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
641 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
638 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  32.1 
 
 
338 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  32.57 
 
 
317 aa  126  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  31.19 
 
 
319 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
639 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  31.35 
 
 
320 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  31.96 
 
 
319 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  31.13 
 
 
324 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  29.02 
 
 
334 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
620 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
620 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
620 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  32.8 
 
 
351 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  32.8 
 
 
351 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  32.4 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  32.06 
 
 
351 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  29.65 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  35.78 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  27.83 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0363  glucokinase  32.69 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  30.87 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  31.55 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  33.74 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  32.28 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.23 
 
 
642 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>