169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0161 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  100 
 
 		 343 aa  681    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  50.75 
 
 		 334 aa  312  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  38.07 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  37.46 
 
 		 343 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  36.87 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  40.6 
 
 		 332 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  39.76 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  38.97 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  39.58 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  39.58 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  40.18 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  36.47 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  38.97 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  36.06 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  35.95 
 
 		 341 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  36.75 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  35.18 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  35.18 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  35.18 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  35.18 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  35.18 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  35.18 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  35.18 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  35.18 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  34.85 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  35.14 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  35.14 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  35.14 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  33.54 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  33.88 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  33.55 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  33.55 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  33.55 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  33.55 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  33.55 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  33.33 
 
 		 316 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  35.44 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 616 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  33.77 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  34.59 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  30.79 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  34.62 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  37.99 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  34.77 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  36.51 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  34.01 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  32.12 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  35.4 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  31.15 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  36.96 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  37.13 
 
 		 319 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  29.32 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  33.33 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  38.19 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  38.11 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  31.09 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  29.78 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  30.77 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  31.96 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  35.48 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  32 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  34.49 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  28.25 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  35.83 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  35.02 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  33.65 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  34.94 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  35.35 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  33.33 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  35.06 
 
 		 324 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3540  glucokinase  34.09 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  34.94 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  34.28 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  34.88 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  31.65 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  33.11 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  32.53 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  33.88 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 638 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  26.81 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1625  glucokinase  35.22 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  34.05 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  29.04 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  29.48 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  33.75 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  34.22 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  33.33 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  32.38 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 639 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 638 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 642 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  34.05 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  33.02 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  33.44 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 641 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 641 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 642 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 642 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 642 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 641 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>