169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3293 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  100 
 
 
320 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  73.75 
 
 
322 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  65 
 
 
322 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3540  glucokinase  65.26 
 
 
322 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  63.32 
 
 
323 aa  391  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1625  glucokinase  49.01 
 
 
322 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  36.77 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  36.98 
 
 
329 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  37.22 
 
 
316 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  34.94 
 
 
321 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  36.79 
 
 
318 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  36.45 
 
 
322 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  36.13 
 
 
323 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  36.13 
 
 
323 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  36.13 
 
 
323 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  34.29 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  34.52 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  35.69 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  34.14 
 
 
334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  32.31 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  34.47 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  33.95 
 
 
341 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  35.85 
 
 
332 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  34.19 
 
 
335 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  38.54 
 
 
319 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  35.16 
 
 
321 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  168  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  34.19 
 
 
335 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  33.82 
 
 
342 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  33.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  33.55 
 
 
321 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  34.3 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  33.87 
 
 
321 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  34.95 
 
 
320 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  36.81 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  37.14 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  35.58 
 
 
339 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  34.45 
 
 
330 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  33.87 
 
 
317 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
641 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  37.66 
 
 
339 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  36.5 
 
 
351 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
641 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
641 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
620 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
620 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
641 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
620 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  35.99 
 
 
336 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  34.15 
 
 
321 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  33.23 
 
 
321 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  37.77 
 
 
334 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1766  glucokinase  35.13 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  37.11 
 
 
337 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  34.19 
 
 
324 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
641 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  34.77 
 
 
319 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  36.39 
 
 
331 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  33.44 
 
 
342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  37.22 
 
 
337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  34.56 
 
 
320 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  35.42 
 
 
335 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
642 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
616 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
642 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
642 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
642 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
642 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  35.89 
 
 
351 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  35.89 
 
 
351 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
642 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
639 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  35 
 
 
319 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
642 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  32.56 
 
 
351 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
638 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  30.84 
 
 
341 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  35.33 
 
 
318 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  36.04 
 
 
328 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  34.06 
 
 
319 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  36.01 
 
 
335 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  33.88 
 
 
326 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  34.52 
 
 
333 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0561  glucokinase  33.23 
 
 
330 aa  142  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
638 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  35.13 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  33.03 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  32.57 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  34.82 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  36.62 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>