170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0774 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  100 
 
 
351 aa  707    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  63.53 
 
 
342 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  62.11 
 
 
341 aa  411  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  56.37 
 
 
353 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  56.74 
 
 
349 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  56.74 
 
 
349 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  47.86 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  51 
 
 
326 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  43.14 
 
 
335 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  41.67 
 
 
334 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  41.79 
 
 
327 aa  255  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  41.79 
 
 
327 aa  252  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  39.07 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  36.86 
 
 
353 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  36.49 
 
 
357 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  37.57 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  37.68 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  35.43 
 
 
344 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0561  glucokinase  38.07 
 
 
330 aa  209  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  36.57 
 
 
341 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  36.86 
 
 
347 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  34.77 
 
 
367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  34.48 
 
 
309 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  36.96 
 
 
320 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  34.47 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  32.96 
 
 
345 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  36.36 
 
 
332 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  32.69 
 
 
344 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  30.75 
 
 
344 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  32.76 
 
 
345 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  33.04 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  34.6 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48774  glucokinase  32.8 
 
 
436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.985035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  34.31 
 
 
322 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  32.26 
 
 
330 aa  170  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  33.43 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  33.24 
 
 
323 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  33.24 
 
 
323 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  33.24 
 
 
323 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  33.53 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  33.53 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  33.53 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  33.53 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  33.53 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  33.53 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  33.53 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  33.53 
 
 
321 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  33.72 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  33.43 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  33.72 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  33.72 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  33.72 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  33.43 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  32.75 
 
 
321 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  34.31 
 
 
322 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3171  glucokinase  36.09 
 
 
361 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  31.98 
 
 
329 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  33.72 
 
 
317 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2875  glucokinase  30 
 
 
317 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1521  glucokinase  30 
 
 
317 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540329  normal  0.172544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  29.36 
 
 
317 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  32.07 
 
 
316 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  31.05 
 
 
341 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  31.21 
 
 
339 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  32.27 
 
 
318 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  32.31 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  30.59 
 
 
319 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  32.84 
 
 
321 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  33.99 
 
 
322 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  32.84 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  32.56 
 
 
320 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  33.33 
 
 
323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  32.25 
 
 
339 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  29.62 
 
 
346 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  32.16 
 
 
321 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  29.88 
 
 
333 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  29.88 
 
 
333 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  29.68 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  32.46 
 
 
332 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  29.07 
 
 
343 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  30.36 
 
 
343 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  28.99 
 
 
340 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  30.68 
 
 
326 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  29.07 
 
 
343 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  30 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  30 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  28.7 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  31.06 
 
 
330 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  30.35 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  31.23 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  29.94 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  32.56 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1655  glucokinase  28.82 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692782  hitchhiker  0.0000702574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  28.96 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  29.82 
 
 
332 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  28.61 
 
 
339 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  28.61 
 
 
339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1981  Glucokinase  31.23 
 
 
328 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3425  glucokinase  27.75 
 
 
339 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0648425 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  27.6 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>