170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0561 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0561  glucokinase  100 
 
 
330 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  47.71 
 
 
327 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  46.79 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  45.68 
 
 
326 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  43.9 
 
 
345 aa  236  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  45.62 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1241  glucokinase  44.38 
 
 
338 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0624  glucokinase  44.38 
 
 
326 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.211034  normal  0.0379456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  39.59 
 
 
341 aa  226  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  38.07 
 
 
351 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  37.72 
 
 
342 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  40.06 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  38.66 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  38.66 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  37.18 
 
 
353 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3171  glucokinase  41.83 
 
 
361 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  37.31 
 
 
353 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  37.99 
 
 
320 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  37.8 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  36.78 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  35.87 
 
 
321 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  37.62 
 
 
309 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0933  glucokinase  35.24 
 
 
357 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.337764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  35.87 
 
 
322 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  38.79 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  36.59 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  34.97 
 
 
320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  36.36 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  36.36 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  36.36 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  36.36 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  36.36 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  36.36 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  36.36 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  36.36 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  36.53 
 
 
323 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  36.53 
 
 
323 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  36.53 
 
 
323 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  36.36 
 
 
321 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  36.67 
 
 
322 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  34.12 
 
 
318 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  35 
 
 
341 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  35 
 
 
339 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  35.91 
 
 
321 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  35.91 
 
 
321 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  35.91 
 
 
321 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  35.91 
 
 
321 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  35.91 
 
 
321 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  36 
 
 
329 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  33.23 
 
 
320 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  36.84 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  32.92 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  34.45 
 
 
321 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  32.44 
 
 
346 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  30.96 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  35.42 
 
 
326 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
616 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  36.53 
 
 
321 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  31.58 
 
 
321 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  33.44 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48774  glucokinase  30.43 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.985035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  34.55 
 
 
319 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  31.62 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  36.21 
 
 
326 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  27.76 
 
 
344 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  35.51 
 
 
325 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1896  glucokinase  32.82 
 
 
322 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.355899  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  29.62 
 
 
367 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  29.06 
 
 
345 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  27.35 
 
 
344 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  32.41 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  33.65 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06521  putative glucokinase  28.57 
 
 
347 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  34.24 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0032  glucokinase  28.06 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  33.95 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  36.33 
 
 
330 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  34.37 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  33.63 
 
 
322 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  35 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  35.26 
 
 
339 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  26.39 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  31.49 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  35 
 
 
320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  31.42 
 
 
332 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  35.38 
 
 
339 aa  126  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  30.87 
 
 
335 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0239  glucokinase  29.54 
 
 
340 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  31.58 
 
 
343 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  32.04 
 
 
337 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  31.52 
 
 
346 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  32.34 
 
 
337 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  34.86 
 
 
331 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  34.68 
 
 
343 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  34.06 
 
 
335 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3540  glucokinase  32.61 
 
 
322 aa  122  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  35.94 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  34.24 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  30.96 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  34.9 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>