244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1610 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  49.36 
 
 
244 aa  228  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  32.35 
 
 
208 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  41.18 
 
 
180 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  36.17 
 
 
193 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  37.31 
 
 
184 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  38.81 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  33.76 
 
 
189 aa  88.6  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  34.75 
 
 
182 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  37.31 
 
 
184 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  36.57 
 
 
184 aa  85.5  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  35.06 
 
 
217 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  34.44 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  33.83 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  34.56 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  34.04 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  34.97 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  42.47 
 
 
146 aa  58.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3763  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3836  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0314  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.46 
 
 
228 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1999  cytochrome c-type biogenesis protein NrfC  35.35 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2384  iron-sulfur cluster-binding protein  30 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0103871  hitchhiker  0.0000955594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1752  iron-sulfur cluster-binding protein  30.65 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000095732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  46.43 
 
 
596 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1871  iron-sulfur cluster-binding protein  30.65 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138753  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1886  iron-sulfur cluster-binding protein  30.65 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000255422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01630  hypothetical protein  30.65 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.523737  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01640  predicted 4Fe-4S ferridoxin-type protein  30.65 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.46353  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.65 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00779006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1960  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.65 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  hitchhiker  0.000000176018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  35.11 
 
 
383 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0183  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.42 
 
 
228 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4152  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.42 
 
 
228 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.42 
 
 
228 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.42 
 
 
228 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  46.88 
 
 
181 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1526  iron-sulfur cluster-binding protein  29.84 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000564469  hitchhiker  0.0000454418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003116  NrfC protein  32.5 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4823  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  29.1 
 
 
415 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0976926 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1432  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  30.6 
 
 
412 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.95 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  40.98 
 
 
201 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1385  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.36 
 
 
195 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  40.32 
 
 
597 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02724  hypothetical protein  33.65 
 
 
165 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1376  pyruvate synthase subunit porD  46 
 
 
102 aa  48.5  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.010194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2903  NrfC, Fe-S-cluster-containing hydrogenase component 1  28.66 
 
 
230 aa  48.5  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.567692  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3256  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  45.65 
 
 
419 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.530562 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1124  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.84 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000563049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2851  flavoprotein  37.68 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0361  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.71 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3562  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3641  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  30.61 
 
 
420 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0922  phenylacrylic acid decarboxylase (PAD)  38.33 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0701  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  45.83 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.684804  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2473  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  30.61 
 
 
420 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0542278  normal  0.668661 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1269  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.08 
 
 
183 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0384604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.68 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2580  flavoprotein  37.68 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3341  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  26.87 
 
 
401 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0429209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  45.28 
 
 
598 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1576  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.91 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.17 
 
 
182 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.99 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0890689  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0387  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.96 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.012768  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0635  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  45.16 
 
 
612 aa  46.6  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3152  electron transport protein HydN  43.75 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0528498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2963  electron transport protein HydN  43.75 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3966  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.29 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
597 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  45.31 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3045  electron transport protein HydN  43.75 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3029  electron transport protein HydN  43.75 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  hitchhiker  0.0000568906 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0815  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  49.09 
 
 
85 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  36 
 
 
398 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0826  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
290 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.456619  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 
619 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1124  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  42.59 
 
 
399 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2358  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  42.19 
 
 
544 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0810  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  26.61 
 
 
188 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2631  Ferredoxin hydrogenase  34.21 
 
 
490 aa  45.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000219307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1238  pyruvate synthase, gamma subunit  45.45 
 
 
310 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
592 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1285  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  35.59 
 
 
175 aa  45.4  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.688553  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2140  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 
188 aa  45.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0385915  normal  0.823652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  40.82 
 
 
653 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3250  hydrogenases, Fe-only  30 
 
 
410 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.644479  hitchhiker  0.0000163586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0775  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.26 
 
 
592 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291818  hitchhiker  0.00672814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  46.67 
 
 
671 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>