18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3144 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  79.45 
 
 		 217 aa  254  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  72 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  73.91 
 
 		 193 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  64.38 
 
 		 205 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  64.29 
 
 		 192 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  51.18 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  47.06 
 
 		 193 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  31.2 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  31.4 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  42.47 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  30.95 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  30.16 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  30.16 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  30.16 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  33.05 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  43.42 
 
 		 244 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  33.33 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>