68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0251 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  100 
 
 		 208 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  71.11 
 
 		 180 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  42.53 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  43.86 
 
 		 184 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  42.11 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  40.94 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  40.34 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  40.35 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  32.35 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  37.78 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  32.6 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  31.71 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  33.72 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  30.05 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  30.77 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  30.86 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  30.56 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  31.4 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3256  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  50 
 
 		 419 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.530562 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1270  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  55.81 
 
 		 399 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1295  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  55.81 
 
 		 399 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2482  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  47.83 
 
 		 385 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.123323  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3811  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  46.67 
 
 		 410 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3341  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  51.16 
 
 		 401 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0429209  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1432  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  47.83 
 
 		 412 aa  45.1  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08660  dipicolinate synthase subunit B  29.32 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0886  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  45.65 
 
 		 401 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1187  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  45.65 
 
 		 414 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2856  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  45.65 
 
 		 383 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1950  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  39.66 
 
 		 401 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1911  DNA/pantothenate metabolism flavoprotein  30.28 
 
 		 418 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1884  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  46.51 
 
 		 379 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2496  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  44.44 
 
 		 413 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3412  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  41.67 
 
 		 411 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1500  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  44.44 
 
 		 394 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1561  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  40.74 
 
 		 411 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1143  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  31.25 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2643  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  42 
 
 		 403 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2552  hypothetical protein  44.44 
 
 		 398 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0778  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  48.84 
 
 		 399 aa  43.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3188  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  48.84 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2473  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  40.68 
 
 		 420 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0542278  normal  0.668661 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1124  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  46.51 
 
 		 399 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5655  flavoprotein  31.58 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640498  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3641  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  40.68 
 
 		 420 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1189  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  44.19 
 
 		 409 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2408  hypothetical protein  44.44 
 
 		 398 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0058  hypothetical protein  24.87 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.504217  hitchhiker  0.00355789 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4823  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  43.75 
 
 		 415 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0976926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1124  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.81 
 
 		 175 aa  42  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000563049  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62046  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  43.14 
 
 		 536 aa  42  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0837  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  39.13 
 
 		 389 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0922  phenylacrylic acid decarboxylase (PAD)  45 
 
 		 181 aa  42  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0384  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, phosphopantothenate--cysteine ligase  44.44 
 
 		 400 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00036859  unclonable  0.0000000000846507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1064  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  46.51 
 
 		 180 aa  42  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0292  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  46.67 
 
 		 408 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1667  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  44.19 
 
 		 411 aa  41.6  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3211  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  31.11 
 
 		 450 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0353325  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0567  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  46.67 
 
 		 386 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.685123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2546  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  44.19 
 
 		 411 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000019633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3482  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  44.44 
 
 		 398 aa  41.6  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1457  dipicolinate synthase subunit B  41.86 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.672991  normal  0.450054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0088  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  46.51 
 
 		 403 aa  41.2  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0158  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  40.74 
 
 		 402 aa  41.2  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.740399  normal  0.0131495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1060  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  44.19 
 
 		 401 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000244734  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0451  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.36 
 
 		 196 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1851  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  47.83 
 
 		 404 aa  41.2  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0881  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  33.9 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>