25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4101 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  53.37 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  54.55 
 
 		 193 aa  181  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  53.45 
 
 		 205 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  50.87 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  47.03 
 
 		 217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  50 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  47.83 
 
 		 146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  34.09 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  31.46 
 
 		 184 aa  99  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  34.66 
 
 		 184 aa  97.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  34.66 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  36.17 
 
 		 239 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  30.46 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  30.86 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  39.86 
 
 		 244 aa  88.2  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  33.53 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  30.05 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0433  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.21 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.989569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2891  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  32.46 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.464506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3525  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  35.59 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0131827  normal  0.173426 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1124  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  34.74 
 
 		 403 aa  45.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2724  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.5 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3594  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  32.46 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.819377 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0922  phenylacrylic acid decarboxylase (PAD)  32.14 
 
 		 181 aa  42  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>