35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0320 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  70.17 
 
 
184 aa  266  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  66.85 
 
 
184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  70.17 
 
 
184 aa  249  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  69.06 
 
 
184 aa  244  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  49.16 
 
 
189 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  43.75 
 
 
180 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  42.53 
 
 
208 aa  165  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  30.46 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  29.14 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  34.85 
 
 
244 aa  88.2  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  33.83 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  31.03 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  31.55 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  29.03 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  27.01 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  30.06 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  33.05 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1306  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  26.99 
 
 
392 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5236  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  35.94 
 
 
422 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1432  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  25.6 
 
 
412 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0886  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  24.8 
 
 
401 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1124  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  37.5 
 
 
399 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3211  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  39.13 
 
 
450 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0353325  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1318  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  28.41 
 
 
405 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1189  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  30.23 
 
 
409 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1759  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  41.67 
 
 
399 aa  41.6  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2496  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  34.48 
 
 
413 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0591  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  38.71 
 
 
399 aa  41.2  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.296634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2546  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  41.67 
 
 
411 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000019633 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0922  phenylacrylic acid decarboxylase (PAD)  38.18 
 
 
181 aa  41.2  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1667  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  41.67 
 
 
411 aa  41.2  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0567  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  39.53 
 
 
386 aa  41.2  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.685123  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2482  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  39.13 
 
 
385 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.123323  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09453  flavoprotein  29.73 
 
 
403 aa  41.2  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.110985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>