42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0245 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  49.16 
 
 
184 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  46.11 
 
 
184 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  44.13 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  46.11 
 
 
184 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  45 
 
 
184 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  40.34 
 
 
208 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  36.63 
 
 
180 aa  131  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  41.3 
 
 
244 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  30.86 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  33.76 
 
 
239 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  30.81 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  29.61 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  34.68 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  31.49 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  32 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  31.14 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  33.33 
 
 
146 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1432  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  29.13 
 
 
412 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3811  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  27.59 
 
 
410 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679589  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2496  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  26.06 
 
 
413 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1189  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  25.95 
 
 
409 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3256  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  23.88 
 
 
419 aa  44.7  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.530562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3661  dipicolinate synthase subunit B  29.23 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.336321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0881  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  25 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0266  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  27.03 
 
 
408 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2408  hypothetical protein  27.36 
 
 
398 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1187  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  25.69 
 
 
414 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1911  DNA/pantothenate metabolism flavoprotein  25.19 
 
 
418 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1561  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  41.51 
 
 
411 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588542  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0567  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  43.48 
 
 
386 aa  42  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.685123  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0837  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  25.58 
 
 
389 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2643  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  27.69 
 
 
403 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3412  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  41.51 
 
 
411 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280261  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0922  phenylacrylic acid decarboxylase (PAD)  43.64 
 
 
181 aa  41.6  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3211  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  52.27 
 
 
450 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0353325  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1143  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  38.89 
 
 
399 aa  41.2  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0886  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  24.26 
 
 
401 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2552  hypothetical protein  27.88 
 
 
398 aa  41.2  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2604  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  26.52 
 
 
425 aa  40.8  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2856  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  25 
 
 
383 aa  41.2  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0451  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  23.26 
 
 
196 aa  40.8  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>