94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1166 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  100 
 
 		 244 aa  493  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  49.36 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  41.3 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  37.78 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  30.83 
 
 		 184 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  35.17 
 
 		 180 aa  93.6  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  39.71 
 
 		 184 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  39.71 
 
 		 184 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  39.86 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  34.85 
 
 		 184 aa  88.2  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  36.76 
 
 		 184 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  35.94 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  42.14 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  44.78 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  41.73 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  39.1 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  38.3 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3256  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  52.63 
 
 		 419 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.530562 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1432  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  37.68 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1614  DNA/pantothenate metabolism flavoprotein  28.74 
 
 		 412 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1884  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  38.55 
 
 		 379 aa  52  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  43.42 
 
 		 146 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0922  phosphopantothenate-cysteine ligase / phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  43.18 
 
 		 377 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0922  phenylacrylic acid decarboxylase (PAD)  28.81 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1187  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  53.49 
 
 		 414 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0013  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  29.65 
 
 		 408 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.432806  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1667  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  45.9 
 
 		 397 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267593  normal  0.691262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  41.38 
 
 		 623 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2856  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  56.52 
 
 		 383 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0567  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  55.81 
 
 		 386 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.685123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1236  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  52.63 
 
 		 376 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.310838  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0701  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.89 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.684804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0830  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  56.52 
 
 		 378 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0426504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1887  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 		 592 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2482  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  52.17 
 
 		 385 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.123323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1561  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  35.9 
 
 		 411 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  30 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4826  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  48.08 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3412  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  35.9 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2077  flavoprotein  30.23 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0886  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  50 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1857  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 		 600 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2546  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  48.89 
 
 		 411 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000019633 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1597  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 607 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1911  DNA/pantothenate metabolism flavoprotein  29.23 
 
 		 418 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1667  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  48.89 
 
 		 411 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1950  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  55.81 
 
 		 401 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0837  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  47.83 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  34.62 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3341  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  55.56 
 
 		 401 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0429209  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 624 aa  43.5  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 		 596 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2786  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  39.22 
 
 		 612 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0890534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  38.18 
 
 		 619 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1588  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 579 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.776403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3211  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  38.89 
 
 		 450 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0353325  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  40 
 
 		 617 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2851  flavoprotein  34.09 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0266  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  28.4 
 
 		 408 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3141  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  25.86 
 
 		 396 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.228093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3661  dipicolinate synthase subunit B  29.69 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.336321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2988  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha  37.74 
 
 		 635 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371879  hitchhiker  0.00474189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3811  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  32.93 
 
 		 410 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2321  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  47.27 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1457  dipicolinate synthase subunit B  51.22 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.672991  normal  0.450054 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0377  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  30.15 
 
 		 592 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00182268  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1251  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  39.22 
 
 		 395 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.932731  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5281  flavoprotein  32.56 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  33.03 
 
 		 658 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0058  indolepyruvate oxidoreductase, subunit  32.31 
 
 		 600 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602223  normal  0.513175 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0173  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  49.09 
 
 		 85 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02930  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  28.37 
 
 		 402 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1060  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  34.33 
 
 		 401 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000244734  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1064  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  46.67 
 
 		 180 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  26.5 
 
 		 598 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0467  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  32.3 
 
 		 424 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.136841  hitchhiker  0.000605246 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0095  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 654 aa  42.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1740  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 578 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1945  polysulfide reductase, subunit B, putative  44 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1172  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.49 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000311269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2704  NADH dehydrogenase (quinone)  27.84 
 
 		 603 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.910602  normal  0.0334637 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1269  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.75 
 
 		 183 aa  42  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0384604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 355 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0171  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  44.44 
 
 		 578 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1702  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  29.63 
 
 		 403 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 623 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.14 
 
 		 258 aa  42  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.3 
 
 		 368 aa  42  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1096  phenylacrylic acid decarboxylase (PAD)  52.94 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0635  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  35.71 
 
 		 612 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.21 
 
 		 1105 aa  41.6  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  44.9 
 
 		 414 aa  41.6  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>