18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2440 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  77.78 
 
 		 205 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  69.27 
 
 		 217 aa  253  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  70.62 
 
 		 193 aa  245  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  65.71 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  64.29 
 
 		 146 aa  184  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  52.27 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  51.48 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  32.2 
 
 		 184 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  35.03 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  32.2 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  32.6 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  31.64 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  31.64 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  34.04 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  29.03 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  41.73 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  31.49 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>