54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0420 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  94.02 
 
 		 184 aa  359  1e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  97.83 
 
 		 184 aa  345  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  87.5 
 
 		 184 aa  339  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  69.06 
 
 		 184 aa  262  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  45 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  40.68 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  40.35 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  34.66 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  39.71 
 
 		 244 aa  96.3  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  33.7 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  30.86 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  37.31 
 
 		 239 aa  92.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  33.7 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  31.64 
 
 		 192 aa  90.9  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  30.94 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  31.28 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  30.65 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1306  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  30.16 
 
 		 392 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1432  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  23.67 
 
 		 412 aa  48.5  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3341  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  34.88 
 
 		 401 aa  48.5  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0429209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1124  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  47.92 
 
 		 399 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1124  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  43.18 
 
 		 403 aa  46.2  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2496  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  41.38 
 
 		 413 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0922  phenylacrylic acid decarboxylase (PAD)  31.19 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5236  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  39.06 
 
 		 422 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1667  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  50 
 
 		 411 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2546  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  50 
 
 		 411 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000019633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0886  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  29.84 
 
 		 401 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0591  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  47.83 
 
 		 399 aa  45.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.296634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1467  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  47.62 
 
 		 406 aa  45.1  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3256  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  39.13 
 
 		 419 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.530562 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1318  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  41.67 
 
 		 405 aa  44.7  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0088  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  45.83 
 
 		 403 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1064  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  33.33 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3211  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  44.19 
 
 		 450 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0353325  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2927  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  45.83 
 
 		 403 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1950  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  50 
 
 		 401 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1235  phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase  29.69 
 
 		 398 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.45651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1759  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  45.83 
 
 		 399 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1060  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  50 
 
 		 401 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000244734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3661  dipicolinate synthase subunit B  29.63 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.336321  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0960  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  27.93 
 
 		 390 aa  42.4  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.129891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3811  bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  39.29 
 
 		 410 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06380  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  43.75 
 
 		 448 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.035596  normal  0.0691838 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1206  flavoprotein  30.83 
 
 		 176 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1251  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  43.75 
 
 		 395 aa  42  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.932731  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2482  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  29.03 
 
 		 385 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.123323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2673  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase / phosphopantothenate-cysteine ligase  45.83 
 
 		 403 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.728378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1147  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  26.98 
 
 		 394 aa  41.6  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.460803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15640  Phosphopantothenate-cysteine ligase /Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase  48.84 
 
 		 412 aa  41.2  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13240  phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase  40 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.494798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1500  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  46.51 
 
 		 394 aa  41.2  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2497  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  40.35 
 
 		 405 aa  40.8  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>