24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2380 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  71.11 
 
 
208 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  43.75 
 
 
184 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  41.24 
 
 
184 aa  153  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  41.24 
 
 
184 aa  151  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  40.68 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  40.68 
 
 
184 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  36.63 
 
 
189 aa  131  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  41.18 
 
 
239 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  35.17 
 
 
244 aa  93.6  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  32.32 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  35.03 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  33.53 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  30.11 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  31.98 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  29.48 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  30.68 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  31.2 
 
 
146 aa  60.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3211  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  48.48 
 
 
450 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0353325  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1500  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  43.9 
 
 
394 aa  42  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3341  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  48.84 
 
 
401 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0429209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1270  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  51.22 
 
 
399 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1295  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  51.22 
 
 
399 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1235  phosphopantothenoylcysteine synthetase/decarboxylase  55.56 
 
 
398 aa  41.2  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.45651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>