19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3076 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3076  flavoprotein  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2615  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  73.48 
 
 		 181 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.433269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5942  flavoprotein  72.88 
 
 		 193 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0152303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6491  flavoprotein  68.31 
 
 		 205 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3144  DNA/pantothenate metabolism flavolike protein  79.45 
 
 		 146 aa  254  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2440  putative dihydromethanopterin reductase (afpA)  69.27 
 
 		 192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1582  flavoprotein  50.83 
 
 		 182 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0132931  unclonable  0.000000170598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4101  flavoprotein  46.99 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.827903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1610  flavoprotein  35.06 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0415  archaeoflavoprotein AfpA  32.04 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0487  archaeoflavoprotein AfpA  30.94 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0251  flavoprotein  30.56 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1504  archaeoflavoprotein AfpA  30.94 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.581089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2380  flavoprotein  30.68 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.212853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0420  flavoprotein  30.94 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1166  flavoprotein  38.3 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.864289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0320  archaeoflavoprotein AfpA  30.06 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.558006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0245  flavoprotein  31.14 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1942  dipicolinate synthase subunit B  26.88 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.746579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>