243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3369 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3369  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
528 aa  1053    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0936236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.16 
 
 
470 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.62 
 
 
452 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  35.2 
 
 
464 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  35.59 
 
 
452 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  33.86 
 
 
452 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.64 
 
 
464 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  35.18 
 
 
467 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 
467 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  34.18 
 
 
446 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  31.66 
 
 
457 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  33.64 
 
 
455 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  32.48 
 
 
452 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  32.12 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  31.42 
 
 
478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.13 
 
 
453 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.41 
 
 
449 aa  217  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  32.41 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  29.98 
 
 
450 aa  212  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  29.98 
 
 
450 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  30.02 
 
 
466 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  31.43 
 
 
451 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  31.19 
 
 
467 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.4 
 
 
486 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 
486 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  32.04 
 
 
461 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  31.05 
 
 
453 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  32.94 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  31.66 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.94 
 
 
452 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  29.75 
 
 
454 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  29.76 
 
 
461 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  31.66 
 
 
468 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  30.73 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  30.86 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  27.13 
 
 
446 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  29.18 
 
 
453 aa  170  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  29.55 
 
 
452 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  29.84 
 
 
463 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.33 
 
 
475 aa  166  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  29.27 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  26.14 
 
 
446 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  29.37 
 
 
454 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  26.42 
 
 
446 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  25.91 
 
 
446 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  27.49 
 
 
455 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  25.97 
 
 
446 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  25.97 
 
 
446 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  26.2 
 
 
446 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  25.97 
 
 
446 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  25.97 
 
 
446 aa  160  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  28.67 
 
 
453 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  25.97 
 
 
446 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  28.57 
 
 
456 aa  159  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  29.41 
 
 
459 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  25.45 
 
 
446 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  30.15 
 
 
449 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  28.25 
 
 
443 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  26.22 
 
 
450 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  24.94 
 
 
454 aa  152  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  28.46 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  28.4 
 
 
453 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  27.42 
 
 
465 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  24.21 
 
 
454 aa  143  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  29.23 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  29.15 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  29.15 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  26.35 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  25.79 
 
 
447 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  27.27 
 
 
469 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  30.24 
 
 
448 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  25.49 
 
 
446 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  25.49 
 
 
446 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  23.97 
 
 
454 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  30.03 
 
 
446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  27.1 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  28.14 
 
 
451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  30.35 
 
 
455 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0092  sodium-dependent transporter, putative  24.88 
 
 
442 aa  133  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  27.98 
 
 
445 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  28.44 
 
 
445 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  28.44 
 
 
445 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  28.44 
 
 
445 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  27.98 
 
 
445 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  27.98 
 
 
445 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  27.98 
 
 
445 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  27.98 
 
 
445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  26.38 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  25.9 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  25.9 
 
 
452 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  25.9 
 
 
452 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  27.32 
 
 
451 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  28.17 
 
 
461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  26.14 
 
 
452 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  26.8 
 
 
456 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  27.29 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  26.25 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  25.66 
 
 
452 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  26.39 
 
 
476 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  22.81 
 
 
447 aa  128  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>