More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf441 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
181 aa  351  2.9999999999999997e-96  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
94 aa  94.7  7e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  46.81 
 
 
94 aa  85.9  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 
91 aa  85.1  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
98 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  50.54 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
94 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 
95 aa  79  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3993  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  48.45 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  46.94 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  47.83 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 
100 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
100 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 
94 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
95 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  44.09 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 
100 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  45.92 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  48.86 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  51.69 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 
93 aa  72  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  41.24 
 
 
97 aa  72  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  44.68 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  42.22 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  38.71 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  44.05 
 
 
97 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
94 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
94 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
94 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  44.05 
 
 
97 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  51.19 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0760  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 
117 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000631754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  41.94 
 
 
97 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  46.43 
 
 
96 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
100 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0052  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000136053  hitchhiker  3.59649e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  40.62 
 
 
95 aa  67  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3177  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3315  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957307  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  44.71 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  35.42 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  41.11 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  44.33 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  38.95 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  41.49 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  37.5 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  41.67 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0055  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 
104 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233404  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0597  50S ribosomal protein L23P  41.67 
 
 
99 aa  63.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000650952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 
100 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  39.53 
 
 
104 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  38.14 
 
 
96 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  42.35 
 
 
100 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  40.91 
 
 
97 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  37.21 
 
 
116 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310283  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  41.94 
 
 
94 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  37.21 
 
 
116 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 
104 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2948  50S ribosomal protein L23  41.05 
 
 
104 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000296107  hitchhiker  0.000000753496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  39.58 
 
 
96 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>