106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02653 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02653  probable oxidoreductase yajO1  100 
 
 
141 aa  296  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.59 
 
 
316 aa  208  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  49.64 
 
 
318 aa  135  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
317 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  34.09 
 
 
301 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
298 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
281 aa  72  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21858  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
326 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 
300 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
320 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  35.07 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
309 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
306 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
298 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
306 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
312 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
306 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
327 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
309 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
306 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
306 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 
304 aa  67  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  36 
 
 
311 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  34.15 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
306 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
302 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 
312 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
305 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
304 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
307 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  30.53 
 
 
300 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
309 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
298 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
300 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
300 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
300 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  30.15 
 
 
308 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 
299 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  33.07 
 
 
308 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
305 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
306 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
315 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
328 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.95 
 
 
329 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.76 
 
 
303 aa  58.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
309 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 
317 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  30.95 
 
 
329 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
304 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  30.95 
 
 
333 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
314 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  31.5 
 
 
300 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
436 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0304773  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
310 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
328 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  29.23 
 
 
302 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
289 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
309 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
289 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
289 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  32.54 
 
 
309 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
298 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
307 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 
328 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
314 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
312 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
305 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
309 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  27.48 
 
 
312 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
271 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
311 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
303 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  32.26 
 
 
309 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 
320 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
297 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
324 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
298 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
314 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
301 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
316 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  27.13 
 
 
316 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
328 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
328 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
319 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
328 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
312 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.02 
 
 
303 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
290 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 
306 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
296 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.4 
 
 
301 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
340 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 
301 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
288 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
328 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>