66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4279 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4279  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  234  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  74.39 
 
 		 215 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  54.32 
 
 		 205 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  57.14 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  49.35 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  41.03 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  48.05 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  48.05 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  49.4 
 
 		 213 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  46.58 
 
 		 355 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  32.73 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.74 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  39.47 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  36.67 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  39.47 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  36.67 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  37.88 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 		 227 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0514  DedA family protein  30.61 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  42.67 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.03 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  36.99 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  32.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3543  DedA family protein  32.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0412  DedA family protein  32.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  40.91 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  50.68 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  42.86 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  43.84 
 
 		 206 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  35.62 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0427  SNARE associated Golgi protein  32.14 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3887  SNARE associated Golgi protein  32.14 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0453  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  32.56 
 
 		 202 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  33.77 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  41.03 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4191  DedA family protein  31.17 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.71 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0439  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0969745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  35.06 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.7 
 
 		 233 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  43.9 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  32.61 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  31.33 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.42 
 
 		 457 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  32.47 
 
 		 172 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  35.23 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  36.89 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  29.49 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2010  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.51 
 
 		 664 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.362381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  29.49 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  35.8 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  39.81 
 
 		 209 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  38.46 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  40.35 
 
 		 204 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  35.62 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  32.71 
 
 		 204 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  31.4 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  31.51 
 
 		 204 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  29.27 
 
 		 211 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  31.17 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  31.17 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  36.21 
 
 		 209 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  29.87 
 
 		 204 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>