119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3417 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3417  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.239422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2858  protein of unknown function DUF924  85.96 
 
 
185 aa  259  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.793513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  54.44 
 
 
204 aa  178  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  51.48 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  55.17 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  54.91 
 
 
184 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  43.24 
 
 
185 aa  164  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  54.49 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  52 
 
 
183 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  50 
 
 
182 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  56.57 
 
 
189 aa  158  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  47.95 
 
 
184 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  49.4 
 
 
179 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  52.51 
 
 
186 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  41.62 
 
 
179 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  47.51 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  39.88 
 
 
178 aa  151  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2276  hypothetical protein  54.17 
 
 
190 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  51.96 
 
 
186 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  42.13 
 
 
180 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  42.13 
 
 
180 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  45.25 
 
 
195 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  43.45 
 
 
178 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  46.71 
 
 
178 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  43.86 
 
 
184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  45.03 
 
 
187 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  42.6 
 
 
180 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  50.29 
 
 
187 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  47.5 
 
 
193 aa  140  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26870  hypothetical protein  54.76 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681787  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  49.38 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  45.4 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  37.36 
 
 
184 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  48.52 
 
 
185 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  48.52 
 
 
178 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  49.71 
 
 
183 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  43.83 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  37.87 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  40.83 
 
 
183 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  48.28 
 
 
193 aa  131  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  45.45 
 
 
144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1919  hypothetical protein  45.76 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  38.8 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  45.12 
 
 
193 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  42.33 
 
 
215 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  38.29 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  39.88 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  39.88 
 
 
183 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  43.81 
 
 
215 aa  125  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  45.51 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  37.71 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  37.71 
 
 
183 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  36.42 
 
 
206 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  43.18 
 
 
197 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  42.86 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1288  protein of unknown function DUF924  46.78 
 
 
204 aa  123  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.733287  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  46.88 
 
 
200 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  34.83 
 
 
186 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  47.85 
 
 
201 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  37.57 
 
 
182 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  38.92 
 
 
180 aa  121  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  35.96 
 
 
192 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  43.78 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  42.86 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  36.69 
 
 
180 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  45.11 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  39.08 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  42.22 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  42.22 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1031  protein of unknown function DUF924  47.43 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  47.56 
 
 
199 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  36.59 
 
 
198 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  41.8 
 
 
205 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  41.32 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1817  hypothetical protein  36.99 
 
 
179 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  36.59 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  45.56 
 
 
441 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  41.11 
 
 
205 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  36.31 
 
 
221 aa  111  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  42.77 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0612  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159886  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  39.41 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  33.14 
 
 
189 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  36.55 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  44.44 
 
 
205 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  43.89 
 
 
205 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3496  protein of unknown function DUF924  41.4 
 
 
194 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.965561  normal  0.476009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2322  hypothetical protein  40.72 
 
 
195 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.691151  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  43.58 
 
 
192 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  42.94 
 
 
192 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  35.43 
 
 
192 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  43.4 
 
 
209 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1848  hypothetical protein  41.48 
 
 
191 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.797702  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  46.11 
 
 
213 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  46.11 
 
 
213 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  46.11 
 
 
213 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  46.11 
 
 
213 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  46.11 
 
 
213 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  46.11 
 
 
213 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>