120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2240 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  94.27 
 
 		 192 aa  349  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  81.25 
 
 		 192 aa  321  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  56.99 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  54.74 
 
 		 200 aa  200  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  53.4 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  52.88 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  52.88 
 
 		 441 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  52.36 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  52.36 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  55.5 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  51.31 
 
 		 205 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  51.81 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  52.88 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  51.05 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  47.8 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  45.74 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  51.31 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  51.58 
 
 		 203 aa  171  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  51.32 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  51.32 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  51.32 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  50.79 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  51.32 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  50 
 
 		 179 aa  164  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  47.92 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  46.28 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  51.85 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  46.7 
 
 		 195 aa  154  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  51.05 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  48.62 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  45.65 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  43.78 
 
 		 178 aa  148  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  41.85 
 
 		 178 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  45.7 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  44.75 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  44.09 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  44.07 
 
 		 180 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  43.09 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  45.25 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  44.62 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  42.27 
 
 		 193 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  40.74 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  45.27 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  46.41 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  41.94 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  42.54 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  41.67 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  44.33 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  39.78 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  40.96 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  41.15 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  40.62 
 
 		 183 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  44.57 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  43.17 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  38.42 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  44.27 
 
 		 183 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  41.18 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  40.1 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  39.89 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  39.89 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  41.49 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  40.74 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  41.27 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  44.86 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  39.56 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  44.86 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  42.16 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  41.84 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  39.34 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  40.51 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  40.1 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  39.89 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  46.41 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  40.22 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  39.47 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1848  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.797702  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  40.78 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1919  hypothetical protein  41.86 
 
 		 183 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  41.8 
 
 		 187 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  35.29 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  46.2 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  43.48 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  46.2 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2459  hypothetical protein  41.49 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  41.56 
 
 		 156 aa  122  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  39.06 
 
 		 215 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2322  hypothetical protein  41.86 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.691151  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  39.29 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  37.63 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  37.77 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1515  hypothetical protein  41.18 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  39.04 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1817  hypothetical protein  37.84 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0353  hypothetical protein  38.14 
 
 		 200 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0612  hypothetical protein  42.58 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159886  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  42.14 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  36.41 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  36.41 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3496  protein of unknown function DUF924  35.08 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.965561  normal  0.476009 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>