121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0113 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  100 
 
 		 185 aa  363  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  100 
 
 		 178 aa  362  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  64.04 
 
 		 178 aa  245  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  65.71 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  65.52 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  65.52 
 
 		 183 aa  233  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  65.52 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  60.45 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  64.37 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  63.22 
 
 		 183 aa  224  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  62.07 
 
 		 206 aa  224  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  63.22 
 
 		 183 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  63.22 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  60.8 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  60.11 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  58.99 
 
 		 178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  56.74 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  60.45 
 
 		 180 aa  218  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  62.64 
 
 		 192 aa  217  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  60.34 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  58.99 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  59.43 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  54.86 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  57.47 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  55.87 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  58.43 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  61.36 
 
 		 186 aa  198  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  55.17 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  56.9 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  60.8 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1817  hypothetical protein  55.93 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  52.57 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  52.66 
 
 		 441 aa  171  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  52.15 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  49.2 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  49.2 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  47.34 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  49.2 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  48.13 
 
 		 211 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  47.59 
 
 		 209 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  49.2 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  42.01 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  47.06 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  51.06 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  51.06 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  51.06 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  51.06 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  51.06 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  51.06 
 
 		 213 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  46.24 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  50.27 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  45.66 
 
 		 204 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  45.66 
 
 		 192 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  43.56 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  49.73 
 
 		 205 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  43.62 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  44.04 
 
 		 199 aa  140  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  41.52 
 
 		 180 aa  140  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  42.01 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  47.13 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  45.4 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  46.24 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  42.7 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  42.61 
 
 		 183 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  47.28 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  41.88 
 
 		 201 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  42.49 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  48.3 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  42.05 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  44.92 
 
 		 211 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  43.6 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2858  protein of unknown function DUF924  49.7 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.793513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  45.24 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  41.18 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  46.29 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3417  hypothetical protein  48.52 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.239422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  43.54 
 
 		 156 aa  125  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  44 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  46.2 
 
 		 192 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  41.04 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0353  hypothetical protein  42.49 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  45.29 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  45.29 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1515  hypothetical protein  41.57 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  45.65 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1919  hypothetical protein  41.21 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  39.58 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  38.42 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  38.42 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1848  hypothetical protein  42.94 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.797702  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  33.66 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  33.66 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  39.66 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0612  hypothetical protein  39.88 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159886  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  36.51 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1031  protein of unknown function DUF924  40.46 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>