120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0977 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  63.93 
 
 		 184 aa  236  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  64.09 
 
 		 183 aa  234  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  62.92 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  62.92 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  61.46 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  61.33 
 
 		 183 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  60.77 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  61.33 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  60.77 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  61.8 
 
 		 183 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  62.36 
 
 		 186 aa  225  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  62.07 
 
 		 182 aa  220  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  60.67 
 
 		 192 aa  220  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  60.92 
 
 		 180 aa  214  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  59.77 
 
 		 180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  58.05 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  54.6 
 
 		 179 aa  204  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  57.47 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  55.17 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  55.17 
 
 		 178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  52.87 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  56.57 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  55.17 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1817  hypothetical protein  56.25 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  54.6 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  54.6 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  56.32 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  55.43 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  56.9 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  48.57 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  43 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  44.92 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  44.33 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  44.33 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  44.33 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  44.06 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  43.14 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  42.25 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  42.86 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  39.9 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  40.57 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  40.23 
 
 		 192 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  39.58 
 
 		 209 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  43.2 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  38.01 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  43.63 
 
 		 205 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  36.57 
 
 		 180 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  40.86 
 
 		 441 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1515  hypothetical protein  42.05 
 
 		 180 aa  128  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  36.78 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  37.36 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  40.94 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  38.82 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  33.67 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  38.69 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  35.39 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  36.31 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  41.58 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1288  protein of unknown function DUF924  36.5 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.733287  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  35.5 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  37.65 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  37.64 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  35.96 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  33.17 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  36.05 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  41.4 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  37.78 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  36.67 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3496  protein of unknown function DUF924  33.51 
 
 		 194 aa  111  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.965561  normal  0.476009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  32.52 
 
 		 222 aa  110  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  40.43 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0612  hypothetical protein  34.66 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159886  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  40.31 
 
 		 213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  36.7 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1919  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  39.67 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  32.47 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  32.96 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  33.16 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  32.47 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0353  hypothetical protein  35.18 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  33.92 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1848  hypothetical protein  36.93 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.797702  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  33.7 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  33.69 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5842  hypothetical protein  37.43 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0947  hypothetical protein  35.03 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  37.78 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  37.77 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  36.52 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  36.52 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  37.22 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.090677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>