119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2034 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  64.14 
 
 
209 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  61.61 
 
 
211 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  58.21 
 
 
205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  58.21 
 
 
205 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  61.14 
 
 
441 aa  232  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  60.51 
 
 
205 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  57.71 
 
 
205 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  57.21 
 
 
205 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  60.51 
 
 
205 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  58.21 
 
 
205 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  59.49 
 
 
213 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  59.07 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  58.55 
 
 
213 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  58.55 
 
 
213 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  58.55 
 
 
213 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  58.55 
 
 
213 aa  208  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  48.69 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  47.18 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  43.68 
 
 
200 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  48.97 
 
 
192 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  43.85 
 
 
190 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  47.92 
 
 
192 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  46.56 
 
 
184 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  46.67 
 
 
203 aa  151  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  44.19 
 
 
215 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  39.18 
 
 
193 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  44.97 
 
 
179 aa  142  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  45.88 
 
 
195 aa  142  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  41.24 
 
 
193 aa  138  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  45.88 
 
 
199 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  44.68 
 
 
183 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  39.36 
 
 
178 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  46.75 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  40.74 
 
 
178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  43.62 
 
 
178 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  39.68 
 
 
183 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  38.83 
 
 
179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  39.68 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  39.15 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  41.18 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  42.02 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  45.03 
 
 
186 aa  128  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  37.77 
 
 
180 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  36.17 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  40.21 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  45.03 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  35.83 
 
 
186 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  43.37 
 
 
192 aa  125  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  39.36 
 
 
182 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  38.69 
 
 
189 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  40.83 
 
 
178 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  38.1 
 
 
183 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  38.5 
 
 
180 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  39.5 
 
 
200 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  44.92 
 
 
178 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  45.99 
 
 
185 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  34.62 
 
 
221 aa  121  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  38.62 
 
 
183 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  39.15 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  40 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  40.83 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  43.64 
 
 
179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  42.2 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  38.1 
 
 
183 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  36.51 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  38.62 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5842  hypothetical protein  41.75 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  42.51 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  39.89 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67470  hypothetical protein  43.08 
 
 
200 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.780785  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  40.74 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  39.68 
 
 
204 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0353  hypothetical protein  41.24 
 
 
200 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  41.58 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1817  hypothetical protein  38.62 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  40.4 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  40.41 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  37.23 
 
 
187 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1515  hypothetical protein  39.36 
 
 
180 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.137634  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  37.7 
 
 
185 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0424  hypothetical protein  40.51 
 
 
198 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.906716  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  39.36 
 
 
189 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5039  hypothetical protein  40.51 
 
 
198 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5089  hypothetical protein  40.51 
 
 
198 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4913  hypothetical protein  40 
 
 
198 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  36.61 
 
 
197 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  104  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1288  protein of unknown function DUF924  39.55 
 
 
204 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.733287  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  38.89 
 
 
183 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  38.1 
 
 
215 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  44.85 
 
 
189 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  38.83 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  37.04 
 
 
183 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  41.36 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2322  hypothetical protein  39.13 
 
 
195 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.691151  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  35.64 
 
 
195 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  40.84 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12949 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>