120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1095 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  401  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  61.05 
 
 		 197 aa  250  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0612  hypothetical protein  52.2 
 
 		 193 aa  184  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159886  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  48.13 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  49.2 
 
 		 191 aa  175  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  49.2 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1848  hypothetical protein  48.92 
 
 		 191 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.797702  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  45.09 
 
 		 180 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  44.51 
 
 		 180 aa  150  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  40.66 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  40.56 
 
 		 182 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  43.02 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  44.75 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  42.78 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  42.13 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  41.21 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  40.11 
 
 		 187 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  39.58 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  38.25 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  39.01 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  37.78 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  38.64 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  38.69 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  36.57 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  37.3 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  46.04 
 
 		 144 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1919  hypothetical protein  41.88 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  37.5 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  39.66 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  41.67 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  36.93 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  38.04 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  38.42 
 
 		 178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  38.3 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  37.29 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  35.8 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  41.21 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  36.36 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  37.76 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  36.36 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  40.11 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  40 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  37.04 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  35.75 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  33.91 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  38.71 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  40.57 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  40.68 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  38.54 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26870  hypothetical protein  38.2 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  34.83 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  40 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  34.66 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  35.91 
 
 		 182 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  35.23 
 
 		 184 aa  111  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  35.56 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  37.23 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  37.23 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  36.31 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1515  hypothetical protein  34.86 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1817  hypothetical protein  36.52 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  36.68 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2276  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  37.77 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  34.9 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  34.68 
 
 		 179 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  36.41 
 
 		 205 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  32.81 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  36.96 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  36.36 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  32.96 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  35.23 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  35.23 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  34.25 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  34.62 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  34.43 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3496  protein of unknown function DUF924  33.68 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.965561  normal  0.476009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  31.82 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2322  hypothetical protein  37.28 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.691151  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  38.42 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  35.96 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3417  hypothetical protein  39.08 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.239422 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  38.42 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2858  protein of unknown function DUF924  39.77 
 
 		 185 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.793513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  32.02 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  36.31 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1031  protein of unknown function DUF924  36.52 
 
 		 187 aa  97.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  38.07 
 
 		 441 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0947  hypothetical protein  33.95 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  36.76 
 
 		 211 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2459  hypothetical protein  36.67 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  35.58 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1288  protein of unknown function DUF924  31.98 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.733287  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  38.04 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  38.04 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>