120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3243 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  100 
 
 
211 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  81.22 
 
 
209 aa  332  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  61.61 
 
 
211 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  65.64 
 
 
205 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  65.13 
 
 
205 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  62.69 
 
 
205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  62.69 
 
 
205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  62.19 
 
 
205 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  66.67 
 
 
441 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  65.64 
 
 
205 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  65.48 
 
 
205 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  64.18 
 
 
213 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  66.14 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  65.28 
 
 
213 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  65.28 
 
 
213 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  65.28 
 
 
213 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  65.28 
 
 
213 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  51.81 
 
 
203 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  48.73 
 
 
201 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  48.4 
 
 
193 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  47.59 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  46.91 
 
 
200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  49.74 
 
 
184 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  50.79 
 
 
192 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  51.05 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  51.05 
 
 
192 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  50.6 
 
 
184 aa  157  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  45.83 
 
 
215 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  46.39 
 
 
193 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  49.21 
 
 
179 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  46.81 
 
 
178 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  43.92 
 
 
183 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  43.92 
 
 
183 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  43.92 
 
 
183 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  43.09 
 
 
178 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  46.07 
 
 
195 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  42.55 
 
 
180 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  41.71 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  42.33 
 
 
183 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  47.98 
 
 
202 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  45.24 
 
 
206 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  42.33 
 
 
183 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  43.01 
 
 
192 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  48.13 
 
 
178 aa  141  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  48.13 
 
 
185 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  42.02 
 
 
178 aa  140  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  49.5 
 
 
186 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  44.32 
 
 
182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  42.21 
 
 
200 aa  138  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  41.58 
 
 
179 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  41.18 
 
 
186 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  49.01 
 
 
186 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  40.74 
 
 
183 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  45.83 
 
 
183 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  40.43 
 
 
182 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  40.21 
 
 
183 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  42.86 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  43.32 
 
 
187 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  40.74 
 
 
178 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  38.83 
 
 
184 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  44.33 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  43.2 
 
 
189 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  42.93 
 
 
180 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  46.34 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  43.39 
 
 
183 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  39.41 
 
 
192 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  41.53 
 
 
180 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  40.44 
 
 
180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  44.79 
 
 
184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  45.83 
 
 
178 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  43.62 
 
 
191 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  45.4 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  43.62 
 
 
191 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1848  hypothetical protein  45.16 
 
 
191 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.797702  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0353  hypothetical protein  44.85 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  42.55 
 
 
189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  45.21 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  43.65 
 
 
183 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67470  hypothetical protein  43.81 
 
 
200 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.780785  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5842  hypothetical protein  43.81 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  44.51 
 
 
192 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  36.67 
 
 
185 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  40.79 
 
 
156 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  40.53 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1288  protein of unknown function DUF924  39.5 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.733287  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1817  hypothetical protein  39.04 
 
 
179 aa  118  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2459  hypothetical protein  41.4 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  39.25 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  39.9 
 
 
222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  37.95 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  37.56 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  37.95 
 
 
198 aa  115  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  43.98 
 
 
189 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  39.66 
 
 
197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1515  hypothetical protein  36.98 
 
 
180 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.137634  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  39.5 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2858  protein of unknown function DUF924  48.75 
 
 
185 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.793513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  36.36 
 
 
193 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  43.06 
 
 
144 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3496  protein of unknown function DUF924  36.13 
 
 
194 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.965561  normal  0.476009 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>