119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1288 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1288  protein of unknown function DUF924  100 
 
 
204 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.733287  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  40.74 
 
 
193 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  41.5 
 
 
156 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  39.2 
 
 
215 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  43.02 
 
 
202 aa  124  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  36.5 
 
 
189 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  38.69 
 
 
200 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  42.26 
 
 
192 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  40.32 
 
 
193 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  42.26 
 
 
183 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  41.62 
 
 
183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  39.5 
 
 
211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  38 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  39 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  38.14 
 
 
199 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  35.38 
 
 
190 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  37.19 
 
 
203 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  39.29 
 
 
204 aa  115  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  35.86 
 
 
215 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  34.36 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  32.8 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  36.79 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  42.13 
 
 
189 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  35.12 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  36.27 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  37.44 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  35.92 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2858  protein of unknown function DUF924  47.37 
 
 
185 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.793513  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  32.45 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  37 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  37 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  36.36 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  35.79 
 
 
195 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  38.01 
 
 
180 aa  109  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  36.32 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  35.03 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  34.67 
 
 
184 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  32.45 
 
 
198 aa  108  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3417  hypothetical protein  46.78 
 
 
183 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.239422 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  37.58 
 
 
144 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  36.14 
 
 
205 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  37.19 
 
 
192 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  36.42 
 
 
178 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  37.43 
 
 
179 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  42.75 
 
 
179 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  39.59 
 
 
441 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  35.68 
 
 
182 aa  104  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  32.65 
 
 
206 aa  104  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  34.09 
 
 
183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  40.52 
 
 
186 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  31.79 
 
 
178 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  34.09 
 
 
183 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  40.26 
 
 
186 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  36.69 
 
 
178 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  34.66 
 
 
183 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  39.55 
 
 
211 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  34.36 
 
 
183 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  37.36 
 
 
205 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  34.09 
 
 
183 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5842  hypothetical protein  40.43 
 
 
200 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67470  hypothetical protein  39.36 
 
 
200 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.780785  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  32.99 
 
 
179 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0353  hypothetical protein  36.08 
 
 
200 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  33.92 
 
 
182 aa  99  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  32.82 
 
 
183 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  39.69 
 
 
213 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  39.69 
 
 
213 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  30.94 
 
 
180 aa  98.6  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  39.69 
 
 
213 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  39.69 
 
 
213 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  39.69 
 
 
213 aa  99  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  36.87 
 
 
195 aa  98.6  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  38.32 
 
 
183 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  39.69 
 
 
213 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  38.37 
 
 
179 aa  98.6  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  34.3 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  34.48 
 
 
197 aa  98.2  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  32.31 
 
 
180 aa  98.2  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5089  hypothetical protein  37.97 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2944  protein of unknown function DUF924  37.31 
 
 
235 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  39.05 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  32.84 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3496  protein of unknown function DUF924  35.98 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.965561  normal  0.476009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  36.84 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  37.29 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  35.26 
 
 
183 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4913  hypothetical protein  37.43 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3296  hypothetical protein  36.92 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00695887  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  37.36 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  32.95 
 
 
178 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5039  hypothetical protein  36.9 
 
 
198 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2459  hypothetical protein  35.64 
 
 
201 aa  92  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2276  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  31.98 
 
 
192 aa  91.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  34.69 
 
 
191 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  34.69 
 
 
191 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  32 
 
 
192 aa  91.3  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  31.95 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  34.65 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0424  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.906716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>