119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2128 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  51.06 
 
 		 193 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  48.94 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  51.81 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  51.81 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  53.16 
 
 		 441 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  48.7 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  47.96 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  49.03 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  52.63 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  50.79 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  50.79 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  50.79 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  48.19 
 
 		 193 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  50.79 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  54.21 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  48.69 
 
 		 205 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  46.28 
 
 		 178 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  48.92 
 
 		 178 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  51.83 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  49.03 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  53.12 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  53.12 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  53.12 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  53.68 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  53.12 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  46.84 
 
 		 184 aa  165  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  53.16 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  43.62 
 
 		 179 aa  161  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  43 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  48.72 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  46.32 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  45.11 
 
 		 180 aa  158  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  44.68 
 
 		 178 aa  157  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  51.58 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  51.55 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  44.39 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  52.15 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  45.21 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  46.67 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  45.16 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  44.97 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  43.62 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  44.74 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  44.97 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  42.55 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  49.49 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  42.25 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  44.44 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  46.03 
 
 		 179 aa  147  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  45.23 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  44.09 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  48.98 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  45.21 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  45.6 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  44.15 
 
 		 183 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  40.32 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67470  hypothetical protein  44.39 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.780785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5842  hypothetical protein  43.08 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  43 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  42.33 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  41.8 
 
 		 183 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  42.33 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  42.86 
 
 		 179 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  44.27 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  39.36 
 
 		 184 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  45.26 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  39.9 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  48.23 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  46.28 
 
 		 183 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0353  hypothetical protein  41.03 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  40.74 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  40.82 
 
 		 192 aa  134  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  39.68 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  42.02 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  44.51 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  42.39 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  38.55 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  42.93 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1817  hypothetical protein  40.86 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  41.72 
 
 		 156 aa  128  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  38.42 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  40.32 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  42.07 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  43.9 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2459  hypothetical protein  39.68 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2858  protein of unknown function DUF924  50 
 
 		 185 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.793513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3417  hypothetical protein  49.38 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.239422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  47.65 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  38.3 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26870  hypothetical protein  46.63 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1919  hypothetical protein  42.69 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0424  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.906716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2276  hypothetical protein  45.4 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4913  hypothetical protein  39.49 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5039  hypothetical protein  39.49 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  34.74 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5089  hypothetical protein  39.49 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>