120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0900 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  64.82 
 
 		 201 aa  272  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  52.63 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  53.65 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  51.05 
 
 		 205 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  51.05 
 
 		 205 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  51.58 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  56.02 
 
 		 192 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  50 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  54.74 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  54.45 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  52.63 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  51.05 
 
 		 441 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  45.88 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  48.7 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  46.91 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  51.58 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  44.97 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  51.58 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  51.58 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  51.58 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  51.58 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  51.05 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  48.17 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  43.68 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  42.56 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  43.81 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  44.72 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  45.92 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  44.09 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  43.68 
 
 		 179 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  42.02 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  44.5 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  41.71 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  42.41 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  41.8 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  43.85 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  47.56 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67470  hypothetical protein  42.79 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.780785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  42.39 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  37.22 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  38.62 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  42 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  41.62 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  39.15 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5842  hypothetical protein  42.29 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  36.51 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  41.5 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  39.47 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  46.67 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  35.2 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  41.8 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  43.64 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  35.6 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  39.27 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  35.75 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  39.15 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  36.65 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  36.65 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  36.98 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  41.53 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  33.17 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  40.98 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  35.98 
 
 		 178 aa  118  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  42.86 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  35.2 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  48.52 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  35.2 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  37.04 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  37.04 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  41.53 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  48.12 
 
 		 144 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  35.2 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  35.71 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  41.32 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1355  hypothetical protein  38.89 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.119247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  41.18 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  41.18 
 
 		 178 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  33.86 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0612  hypothetical protein  41.76 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159886  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0353  hypothetical protein  39.8 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  33.5 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0246  hypothetical protein  35.95 
 
 		 156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314293  decreased coverage  0.00240623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  36.84 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  36.73 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4034  hypothetical protein  32.2 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1919  hypothetical protein  37.02 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1848  hypothetical protein  40.33 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.797702  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  34.92 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3353  hypothetical protein  33.68 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.227691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2459  hypothetical protein  39.57 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0424  hypothetical protein  36.82 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.906716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  34.76 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5089  hypothetical protein  37.31 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5039  hypothetical protein  37.31 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2322  hypothetical protein  35.68 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.691151  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4913  hypothetical protein  36.82 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>