119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2322 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2322  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.691151  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1919  hypothetical protein  47.22 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0068  hypothetical protein  40.68 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1186  hypothetical protein  39.88 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3158  protein of unknown function DUF924  43.18 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1802  hypothetical protein  39.44 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.796326  hitchhiker  0.000766367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4593  hypothetical protein  41.86 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2423  protein of unknown function DUF924  42.5 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2005  hypothetical protein  37.28 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0462  hypothetical protein  42.39 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2315  hypothetical protein  40.22 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734468  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4367  hypothetical protein  41.21 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.929478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2217  protein of unknown function DUF924  39.23 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3371  protein of unknown function DUF924  40 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.568192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2089  putative transmembrane protein  41.28 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1031  hypothetical protein  39.78 
 
 		 441 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1665  hypothetical protein  39.13 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2308  hypothetical protein  39.66 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2277  hypothetical protein  39.13 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1146  hypothetical protein  46.55 
 
 		 144 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.917642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2164  protein of unknown function DUF924  41.25 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5604  hypothetical protein  38.59 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453202  normal  0.892722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2300  hypothetical protein  38.59 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1848  hypothetical protein  40.91 
 
 		 191 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.797702  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1916  protein of unknown function DUF924  41.95 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1662  hypothetical protein  38.95 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0612  hypothetical protein  40.48 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159886  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2685  hypothetical protein  40.56 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2797  hypothetical protein  36.57 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.700823  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1503  hypothetical protein  32.61 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2969  hypothetical protein  41.04 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5377  protein of unknown function DUF924  35.71 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.828923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2459  hypothetical protein  37.85 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1615  hypothetical protein  41.04 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3383  hypothetical protein  43.18 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.245058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2240  protein of unknown function DUF924  41.86 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3897  hypothetical protein  34.73 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1001  hypothetical protein  39.67 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1865  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1137  hypothetical protein  37.63 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.862902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1097  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0769  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1256  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.904377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0380  hypothetical protein  40.32 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2193  hypothetical protein  40.22 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0079  protein of unknown function DUF924  41.88 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0900  hypothetical protein  35.68 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1264  hypothetical protein  39.78 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1927  hypothetical protein  42.46 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3961  hypothetical protein  38.15 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000888  protein of unknown function DUF924  35.06 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2734  protein of unknown function DUF924  35.06 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0844788  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3733  hypothetical protein  37.85 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1095  hypothetical protein  37.28 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3311  protein of unknown function DUF924  37.57 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0936  hypothetical protein  35.11 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0861  hypothetical protein  34.92 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00340964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1317  protein of unknown function DUF924  40.13 
 
 		 209 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481776  normal  0.143427 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1014  hypothetical protein  34.12 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1719  hypothetical protein  35.56 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.986012  normal  0.328993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2034  hypothetical protein  39.13 
 
 		 211 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2128  hypothetical protein  36.7 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0785  hypothetical protein  34.08 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000160296  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3243  putative transmembrane protein  38.51 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1812  hypothetical protein  36.21 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.226797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0106  hypothetical protein  30.81 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3246  hypothetical protein  35.23 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0509  hypothetical protein  38.69 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0689  protein of unknown function DUF924  28.74 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3417  hypothetical protein  40.72 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.239422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2121  hypothetical protein  32.53 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0348041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1031  protein of unknown function DUF924  38.15 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3345  hypothetical protein  36.31 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2858  protein of unknown function DUF924  44.16 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.793513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02492  hypothetical protein  32.95 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.079493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0877  hypothetical protein  33.73 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2914  hypothetical protein  30.99 
 
 		 180 aa  88.2  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1288  protein of unknown function DUF924  37.5 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.733287  normal  0.0310315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3145  hypothetical protein  33.53 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1516  hypothetical protein  34.91 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2276  hypothetical protein  39.26 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1515  hypothetical protein  35.33 
 
 		 180 aa  85.5  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3327  hypothetical protein  33.52 
 
 		 183 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06871  hypothetical protein  36.75 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0977  hypothetical protein  31.79 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185286  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0947  hypothetical protein  32.3 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0939  hypothetical protein  28.99 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26870  hypothetical protein  32.29 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.681787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2824  hypothetical protein  30.91 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1045  hypothetical protein  31.43 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3704  hypothetical protein  31.71 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.377391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1012  hypothetical protein  32.39 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0112  conserved hypothetical protein TIGR00650  38.24 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0113  protein of unknown function DUF924  38.24 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1033  protein of unknown function DUF924  32.39 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3093  hypothetical protein  32.35 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1181  hypothetical protein  29.8 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000108279  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0851  hypothetical protein  29.8 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0902  hypothetical protein  37.5 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997566 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>