More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2890 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2890  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  486  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  73.3 
 
 		 193 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  72.04 
 
 		 193 aa  268  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  69.95 
 
 		 193 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  69.95 
 
 		 193 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  71.51 
 
 		 193 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  46.7 
 
 		 188 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.62 
 
 		 182 aa  141  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.6 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 		 185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  45.6 
 
 		 185 aa  138  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.2 
 
 		 189 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 186 aa  134  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  43.96 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  42.71 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  45.9 
 
 		 188 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 194 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  44.51 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  44.51 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  42.37 
 
 		 187 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  42.16 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  45.76 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  45.76 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  45.36 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  40.49 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  42.55 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  44.26 
 
 		 184 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  41.36 
 
 		 188 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  42.47 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  41.8 
 
 		 190 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  42.7 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  43.89 
 
 		 197 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 		 201 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  41.8 
 
 		 197 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  41.8 
 
 		 197 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  41.8 
 
 		 197 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.55 
 
 		 188 aa  121  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  40.11 
 
 		 194 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  39.78 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  42.78 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  39.27 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  43.78 
 
 		 198 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  41.99 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  41.4 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  41.4 
 
 		 204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  38.2 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  40.66 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  41.76 
 
 		 194 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  41.76 
 
 		 194 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  41.3 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  41.15 
 
 		 190 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  45 
 
 		 190 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 193 aa  113  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  41.28 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  36.27 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  38.76 
 
 		 184 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.98 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  40.57 
 
 		 192 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.05 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  41.53 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  41.86 
 
 		 196 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.12 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  39.23 
 
 		 197 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  35.33 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  35.33 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  36.81 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  42.77 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 163 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  34.92 
 
 		 192 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 184 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  35.87 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  42.16 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  39.31 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  44.29 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  35 
 
 		 184 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  34.83 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  40.11 
 
 		 184 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.33 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  36.76 
 
 		 181 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  46.46 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  46.46 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  46.46 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.13 
 
 		 197 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  39.15 
 
 		 190 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>