137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0953 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0953  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
125 aa  239  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  44.14 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  38.79 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  38.14 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  36.84 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  29.92 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  34.17 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  34.38 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  39.2 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  35.34 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  38.98 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  31.45 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  32.76 
 
 
134 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
154 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2659  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298553  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  31.71 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
126 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
127 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.46 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  33.61 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 
119 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0519  Camphor resistance CrcB protein  31.9 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  30.51 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  27.42 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  37.89 
 
 
228 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  33.33 
 
 
127 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
140 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  41.43 
 
 
125 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  31.36 
 
 
124 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  30 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  30.33 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  29.27 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  36.47 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  29.66 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  32.48 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  37.65 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  30.84 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  30.33 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  33.7 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1481  camphor resistance CrcB protein  32.58 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  34.4 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  31.48 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  34.04 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  36.47 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  28.69 
 
 
124 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  29.55 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  28.23 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  37 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2562  Camphor resistance CrcB protein  33.04 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  28.28 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  32.98 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  31.91 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  28.69 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  34.44 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>